Директор развозит товар по торг. точкам на личном транспорте...

Чё лень поиск открыть чтоль, как в детсаду ;)
Плательщики транспортного налога
Статья 357 НК РФ определяет, кто является налогоплательщиком транспортного налога. Налогоплательщиками являются как физические, так и юридические лица, на которых зарегистрированы транспортные средства.
Обратите внимание, если транспортные средства не зарегистрированы за организацией, а используются ею на праве хозяйственного ведения, то по таким транспортным средствам организация не является налогоплательщиком транспортного налога. Такой вывод подтверждается и судебной практикой.
....
Итак, обязанность по уплате транспортного налога ставится в зависимость от регистрации транспортного средства, а не от фактического использования транспортного средства, а налогоплательщиком транспортного налога признается лицо, на которое зарегистрировано транспортное средство, то есть владелец транспортного средства. Об этом сказано в Письме Минфина Российской Федерации от 6 мая 2006 года №03-06-04-04/15 «О вопросе исчисления и уплаты транспортного налога» .

А вот действует ли это письмо ищите сами, но по логике вещей должно, врятли Минфин умом тронулся и придумал наоборот что-нибудь ;)
Соответственно вопрос об .. "и сбора за загрязнение окруж. среды" отпадает сам собой, в части привязке его к автомобилю, а так может у вас котельная есть на угле например, вот по ней вы будите платить ...наверное ;)

на балансе у Вас транспорта нет, значит, налоги не платите.

Плательщиком транспорного налога не являетесь, его платит директор как собственник этого ТС.