Какие доходы и расходы учитываются при исчислении налоговой база, если система налогообложения УСН 15% для ИП.

1) Когда вносите деньги на расчетный счет как выручку - один код источника, когда как пополнение - другой код. В выписке с расчетного счета это должно быть видно. Уточните коды в своем банке.
2) Надо было предоплату вносить в доход, это же оплата за товар. По факту поступления на р/счет доход считается. Возврат - пишете в КУДиР со знаком минус, этот возврат уменьшит доход уже в другом налоговом периоде.
3) Комиссия которая списывается самим банком (за ведение р/сч) учитываются как расход при исчислении налоговой базы.

1 собственные средства не считаются, вдруг вы их заняли у кого то...
Все документы сохраняйте, чиобы в случае проверки можно было объяснить инспектору..
2 тоже не считается, деньги же вернули

3 комиссию за ведение счета тоже можно учесть как расходы

Посмотрите НК РФ, там прописаны расходы которые можно принимать к учету по УСН и только их, больше никакие.

1. В первом пункте важно с какой формулировкой внесены средств на счет, правильно (пополнение расчетного счета собственными средствами) может быть вариант по договору займа тогда суммы внесения не облагаются налогом. В остальных случаях при внесении денег придется заплатить налог упрощенща.

2. На упрощенке авансы от покупателей нужно включать в доходы и, соответственно, платить с них налог в периоде их получения. А если поставка не состоялась и аванс вы возвращаете, то на его сумму следует уменьшить доходы того периода, в котором вы аванс вернулип. 1 ст. 346.17 НК РФ; Письмо Минфина от 06.07.2012 № 03-11-11/204. Для этого в Книге учета доходов и расходов, в графе 4 раздела I, нужно записать возвращенную сумму со знаком минус. И в расчет налога по итогам периода войдет уже уменьшенная на возвращенный аванс сумма доходов. Это правило действует как для «доходной», так и для «доходно-расходной» упрощенки.

Для уменьшения доходов на возвращенный аванс у вас должны быть документы, подтверждающие факт, основание и сумму возвратаПисьмо ФНС от 24.05.2010 № ШС-37-3/2356@ (например, соглашение о расторжении договора, платежное поручение, а если вернули деньги наличными — ПКО несостоявшегося покупателя). При внесении в Книгу записи о возвращенном авансе реквизиты этих документов нужно указать в графе 2 раздела I.

3. Комиссия учитывается в расход при исчислении налоговой базе если УСНО доходы минус расходы, а если доходы то не учитывается.