Имеют ли право лишить авто гарантии, если сигнализация установлена не в фирменном сервисе?

Условия договора признаются недействительными ТОЛЬКО по решению суда. Не надо заблуждаться относительно того мнения, если вам кажется, что условия недействительны - они и являются таковыми. Нет, это тяжелая юридическая работа, которая требуется определенных усилий. Что касается сигнализации - в условиях договора четко должно прописываться, что именно подпадает под гарантию. Если же таких условий нет - под гарантию попадают все узлы, агрегаты и запасные части автомобиля.
Если Вы установите сигнализацию в другом месте- - не у официально диллера, мой вам совет: обязательно возьмите выписку о том, что автосервис имеет право устанавливать сигнализации, автомеханник имеет соответствующее образование, либо у него есть соответствующий сертификат о прохождении обучения в области установки сигнализации, правоустанавливающие документы.
Если же все-таки в договоре или в условиях гарантии прописано, что клиент не имеет право устанавливать сигнализацию в ином месте, добро пожаловать в суд!

Все будет зависеть от того, нарушил или нет сервис требования-завода изготовителя к установке опций. Если во время гарантийного обслуживания будет установлено, что сервис нарушил требования завода-изготовителя и эти нарушения, н-р, могут привести к аварийному режиму работы электросети и пожару, то о какой гарантии может идти речь? И никакой закон о защите прав потребителя здесь не поможет. Иное противоречило бы и здравому смыслу и закону.

нет, только если экспертиза, которую продавец обязан провести за свой счет, установит, что поломка произошла из-за неправильной установки сигнализации

Условия договора, ущемляющие права потребителя по сравнению с правилами, установленными законами или иными правовыми актами Российской Федерации в области защиты прав потребителей, признаются недействительными.
Если в результате исполнения договора, ущемляющего права потребителя, у него возникли убытки, они подлежат возмещению изготовителем (исполнителем, продавцом) в полном объеме.
Запрещается обусловливать приобретение одних товаров (работ, услуг) обязательным приобретением иных товаров (работ, услуг) . Убытки, причиненные потребителю вследствие нарушения его права на свободный выбор товаров (работ, услуг) , возмещаются продавцом (исполнителем) в полном объеме.
Запрещается обусловливать удовлетворение требований потребителей, предъявляемых в течение гарантийного срока, условиями, не связанными с недостатками товаров (работ, услуг) .
Продавец (исполнитель) не вправе без согласия потребителя выполнять дополнительные работы, услуги за плату. Потребитель вправе отказаться от оплаты таких работ (услуг) , а если они оплачены, потребитель вправе потребовать от продавца (исполнителя) возврата уплаченной суммы.