сыну чуть больше 2 лет, стал бояться...

У нас как-то само прошло.
Могу посоветовать купить ему игрушку-лягушку и с ней спать ложиться. Объясните - лягушки едят насекомых (мух, жучков, паучков) .
Мой сын с месяц в туалет ходил в собачкой - она его "охраняла".

пройдёт и это,
читать про Муху-Цокотуху, мультик найти.. .
и самой не паниковать.. .

Рассказывать какие на самом деле маленькие мухи и комарики, смотреть вместе мультики про насекомых, читать стихи и сказки про Муху-цекотуху и прочих насекомых. Научить, что жужжащие насекомые не реагируют на неподвижно стоящего человека. Обьяснить, что насекомые сами боятся людей.
Учиться рисовать бабочек, жучков и комариков. Найти компьютерную игру с насекомыми и играть.

да ему надо защиту .Покахонтас правильно сказала .

согласна с Покахонтос.... да и святая водица не помешает....

Моя дочка тоже в этом возрасте начала их бояться и боится до сих пор (5 лет ей) , конечно не так панически, но боится. . Почему-не знаю..

и у нас вдруг стали боятся птичек, и от собак шарахаемся... до этого хоть слона, не боялись.

это нормальная реакция всех детей, ведь у всех появляются свои страхи
познакомьте сына с мухами, и впрямь, посмотрите мультики, понаблюдайте за ними, расскажите, кто они такие, как они устроены
страх пройдет постепенно

Святой водой умой перед сном и вытри лицо своим подолом ночнушки, и попить ему давай (святой воды).

у нас сейчас также (год и десять) мы показываем игрушечных насекомых а вообще это испуг лучше конечно отлить воском к знахарю или зайди на заговоры и сома