физическое лицо, владелец имущества, поручило юридическому лицу организовать хранение имущества на складе третьего лица

проблемы не вижу

Поклажедателем может быть лицо, не являющееся собственником вещи, например действующее на основании закона или договора.
Постановление Президиума ВАС РФ от 17.10.2006 N 7074/06 по делу N А07-32282/05-Г-СМШ

Поклажедатель может требовать возврата имущества независимо от того, на каком праве оно ему принадлежит.
из родного пример :)
Постановление ФАС Поволжского округа от 15.08.2007 по делу N А12-34038/05
"...В соответствии с ч. 1 ст. 900 Гражданского кодекса Российской Федерации хранитель обязан возвратить поклажедателю или лицу, указанному им в качестве получателя, ту самую вещь, которая была передана на хранение, если договором не предусмотрено хранение с обезличением (ст. 890).
На основании указанной нормы суд апелляционной инстанции обоснованно удовлетворил иск.
При этом суд апелляционной инстанции правильно указал на ошибочность вывода суда первой инстанции о том, что истец должен доказать право собственности или иное право на имущество, являющееся предметом иска.
Отношения сторон обусловлены договором хранения. Вопрос о принадлежности вещи поклажедателю на праве собственности или ином праве не имеет правового значения и не влияет на обязанность хранителя возвратить поклажедателю вещь, принятую на хранение... "

Из данной ситуации не понятно является ли юр. лицо первоначальным хранителем или просто действовало по поручению физ. лиц, передать имущество на хранение третьему лицу. Буду исходить из того, что юр. лицо является первоначальным хранителем. Исходя из ст. 895 ГК РФ, Лицо, взявшее имущество на хранение, обязано само осуществлять хранение, отсюда следует, что, хранитель может передать имущество на хранение другому лицу только с согласия поклажедателя. Поскольку юр. лицо действовало по поручению физ. лица (поклажедателя) , то передача имущества на хранение третьему лицу является правомерным. Передача имущества на хранение третьему лицу не изменяет условий договора между первоначальным хранителем и поклажедателем. При передаче вещи на хранение третьему лицу условия договора между поклажедателем и первоначальным хранителем сохраняют силу и последний отвечает за действия третьего лица, которому он передал вещь на хранение, как за свои собственные. Пункт 1 ст. 900 ГК РФ, устанавливается обязанность хранителя возвратить вещь, переданную на хранение, т. к. по определению договора хранения (п. 1 ст. 886 ГК РФ) принятие вещи на хранение сопровождается обязанностью возвратить ее. Вещь должна быть возвращена именно тому лицу, которое отдало ее хранителю на хранение, или тому, от имени которого она была отдана, или же лицу, уполномоченному по договору получить вещь. Хранитель не обязан и не вправе требовать доказательств, удостоверяющих право собственности на вещь.
Отсюда следует, что поклажедатель (физ. лицо) , должен предъявить иск к хранителю (юр. лицу) . Иск подаётся по месту нахождения юридического лица.