Если речь идёт об ЭКОНОМИЧЕСКИХ регионах (районах) , то надо так и спрашивать: "В России 12 экономических регионов. Перечислите, пожалуйста, их названия".
Экономических районов действительно двенадцать:
1. Центральный
2. Центрально-Чернозёмный
3. Восточно-Сибирский
4. Дальневосточный
5. Северный
6. Северо-Кавказский
7. Северо-Западный
8. Поволжский
9. Уральский
10. Волго-Вятский
11. Западно-Сибирский
12. Калининградская область в составе СССР входила в Прибалтийский экономический район, а в настоящее время она входит в Северо-Западный экономический район. В то же время Калининградская область признана особой экономической зоной.

Уточнение к другим ответам: регионов - субъектов федерации в России на данный момент не 89, а 83.