Привет всем, у меня такой вопрос, имеется 2 диска. Samsung 980pro 500gb, и Samsung 980 500gb.

Да. Только вы для начала определитесь, что вы удаляете: диск или раздел?

Если системный раздел занимает не весь диск, то можно в любой момент создать раздел(ы) на оставшемся пространстве или расширить раздел, к верхней границе которого примыкает свободное пространство, без потери данных на расширяемом разделе.

Удаление раздела удаляет все файлы на нём, в случае ssd - практически без шанса восстановить их. Другие разделы не страдают.

Добавление накопителя в систему может изменить буквы, назначенные виндой. А букву системного раздела лучше не менять. Но это решаемо. Проще всего, тем не менее, сразу ставить винду на такую конфигурацию накопителей, в которой она будет потом работать.

Если вы задаете такие вопросы, то советую выбрать ссд на который вы хотите залить ОС, другой диск выньте. И спокойно установите ОС.
Проблема ламеров стандартна, ОС на ордном диске, загрузчик на другом! Судя по вашему ыопросу вы не далеко от этого. ;)))

При установке можно удалить все разделы дисков, создать новые разделы, ну или это можно сделать потом, из ОС. Удаленные разделы станут неразмеченными областями, которые мона разметить через менеджер дисков в ОС.

долгая история

Ничего. Все сможете. А вообще, порядок накопителей можно посмотреть в BIOS.

Нельзя диск удалить, только его раздел, если раздел удалишь то просто всё что там было удалится

При установке системы имея лишь один диск, заранее разграничте томы для системы, резервных копий и для основных данных, иначе потом это будет сделать проблематично и скорее всего с ошибками при малом остаточном объеме для системы, или вообще будет невозможно разграничить новый том без форматирования всего диска