В суде адвокат заявляет ходатайство о признании ряда документов недопустимым доказательством

Прокурор: Прошу отказать в удовлетворении ходатайства, поскольку оно - преждевременно и необоснованно.

Начну с того, что если действительно адвокат прав и подтвердится, что непонятен и не прослеживается, а главное не подтвержден документально, процесс появления документов в уголовном деле, то суд удовлетворит ходатайство защитника и признает их не допустимыми.
На месте государственного обвинителя я бы начал с возражения на ходатайство защитника, особенно если указанные в нем документы не исследовались в судебном заседании, следовательно ходатайство, как минимум, заявлено преждевременно (этим бы можно было получить дополнительное время на решение проблемы) . Если видно, что судья настроен на удовлетворение ходатайства защитника (а тем более на оправдание подсудимого, что обычно по поведению судьи в процессе видно) , то попросить отложить судебное заседание для предоставление времени на ознакомление с ходатайством и только после такого ознакомления высказывать свою позицию по нему.
Далее нужно доказать, что на самом деле защитник не прав и протоколы выемок, осмотров, обысков и т. п. подобное имеются в материалах дела. Обязательно бы заявил ходатайство о допросе следователя по поводу появления документов в деле, с предварительной выработкой позиции наилучшей для стороны обвинения (например выемка была, но вот протокол почему-то "забыли" приобщить к материалам дела и сейчас он может быть представлен суду, причем оформленный по требованиям УПК РФ с понятыми и подписями).

Я невеликий специалист в области уголовного права, но думаю, что обвинителю не остается ничего как не возражать против такого ходатайства.

Высказал бы мнени: в удовлетворении ходатайства отказать, как необоснованное, Каждый отрабатывает свой хлеб. Адвокату - адвокатово, прокурору - прокуророво.

не возражать не получиться, так ккак сама позиция прокурора не позволяет этого сделать (уволят нафиг при случае) это только в кино прокурор отказывается от обвинения, в реальности лучше получить взыскание за оправдательный приговор чем признат ошибку обвинения. по ходатайству надо возражать и потивировать каким нибудь шлупыми доводами мол нет никаких нарушений, следователь делал все в ситуации нетерпящей отлагательств и что то в этом роде.

а так на будущее надо смотреть когда обвинительное заключение подписывается прокурором нет нли нарушения норм УПК.