бывшая мужа подала на алименты, один ребенок его а другой просто на него записан (выплачивать на двоих) как быть?

Оспаривать отцовство в отношении чужого ребенка, а на своего платить алименты.
Ситуация простая и часто встречающаяся - мужчины не торопятся оформить развод, не понимая, что если в период брака у жензины рождается ребенок (или спустя 300дн. после расторжения брака) , то отцом ребенка по документам ЗАГС является МУЖ (мужа даже в известность не ставят что у его жены кто-то родился) и оспорить это можно только через суд.
Как подала на алименты? подала заявление на выдачу суд. приказа? оспаривайте, подавайте встречный иск об оспаривании отцовства.

Статья 48 СК РФ. Установление происхождения ребенка

1. Происхождение ребенка от матери (материнство) устанавливается на основании документов, подтверждающих рождение ребенка матерью в медицинском учреждении, а в случае рождения ребенка вне медицинского учреждения на основании медицинских документов, свидетельских показаний или на основании иных доказательств.
2. Если ребенок родился от лиц, состоящих в браке между собой, а также в течение трехсот дней с момента расторжения брака, признания его недействительным или с момента смерти супруга матери ребенка, отцом ребенка признается супруг (бывший супруг) матери, если не доказано иное (статья 52 настоящего Кодекса) . Отцовство супруга матери ребенка удостоверяется записью об их браке.
3. Исключен. - Федеральный закон от 15.11.1997 N 140-ФЗ.
3. Отцовство лица, не состоящего в браке с матерью ребенка, устанавливается путем подачи в орган записи актов гражданского состояния совместного заявления отцом и матерью ребенка; в случае смерти матери, признания ее недееспособной, невозможности установления места нахождения матери или в случае лишения ее родительских прав - по заявлению отца ребенка с согласия органа опеки и попечительства, при отсутствии такого согласия - по решению суда.
При наличии обстоятельств, дающих основания предполагать, что подача совместного заявления об установлении отцовства может оказаться после рождения ребенка невозможной или затруднительной, родители будущего ребенка, не состоящие между собой в браке, вправе подать такое заявление в орган записи актов гражданского состояния во время беременности матери. Запись о родителях ребенка производится после рождения ребенка.
4. Установление отцовства в отношении лица, достигшего возраста восемнадцати лет (совершеннолетия) , допускается только с его согласия, а если оно признано недееспособным, - с согласия его опекуна или органа опеки и попечительства.
Обратите внимание на п. 2 статьи - ЕСЛИ НЕ ДОКАЗАНО ИНОЕ. ВОТ И ДОКАЖИТЕ, что второй ребенок не его.

Статья 52 СК РФ. Оспаривание отцовства (материнства)
1. Запись родителей в книге записей рождений, произведенная в соответствии с пунктами 1 и 2 статьи 51 настоящего Кодекса, может быть оспорена только в судебном порядке по требованию лица, записанного в качестве отца или матери ребенка, либо лица, фактически являющегося отцом или матерью ребенка, а также самого ребенка по достижении им совершеннолетия, опекуна (попечителя) ребенка, опекуна родителя, признанного судом недееспособным.

В качестве доказательств подойдут свидетельские показания, отсутствие в месте проживания матери в предполагаемый период зачатия ребенка. генетические экспертиза. в конце концов.

если ваш это знал, то надо было сразу действовать-если прошло 3 года, то ничего не сделать

Никак не быть - платить. Дети родные и усыновлённые равны в правах. Даже если бы делалась экспертиза ДНК, и оказалось бы, что ребёнок не его, но им усыновлён, алименты платить ему.

по закону придется выплачивать, если второй ребенок усыновлен

Вопрос, конечно, интересный. но раз ваш супруг записал его на себя, значит, это его ребёнок. И алименты надо будет выплачивать

даже если и не его ребенок -будет платить на двоих, пока в суде не докажет, что это не его дитя и он в период зачатия не жил с бывшей женой

что значит на него записан - он его усыновил - значит должен платить алименты