Что будет с домом купленным частично на маткапитал?

Вы пишите: "Я являюсь женой того, с кем все это произошло. И сейчас так как с нами только младший проживает, а двух других под опеку не дают, мы стараемся решить вопрос с домом так, чтоб это небыло в ущерб двум другим малышам."
Непонятно ничего.
Что произошло с вашим мужем (заключен ли у вас брак в ЗАГС с этим "мужем"?)?.
Этот ваш "муж" - он же бывший сожитель некоей женщины, лишенной родительских прав?
И именно ему эта его бывшая сожительница продала свою долю в доме?
Почему младший ребенок этой женщины, лишенной родит. прав, "живет с вами"?
Ваш нынешний "муж", он же бывший сожитель этой женщины- отец этого младшего ребенка?
Но при этом он не отец др. детей, ровно поэтому др. дети не могут с ним жить, и он может стать их опекуном, если хочет и решит суд.
Непонятно, чего хочет ваш нынешний "муж" и чего хотите Вы.
В принципе, раз у него доля в доме в собственности и у его ребенка, и пусть живут они в этом доме, а старшие дети в др. семьях или детдоме.
Потом дети вырастут и придут в дом жить на правах собственников.
Вас вселить можно как члена семьи собственника с согласия вшего мужа и от имени млад. ребенка он же, а от имени др. детей- их опекуны.
А продать дом, в кот. несоверш. сособственники можно только с согласия их законных представителей, опекунов и органа опеки.
Ну и, чтобы жилищ. и имуществ. права несоверш. собственников не нарушались, им надо в собственность купить жилые помещения или доли в ином жилом помещении по площади не меньше, чем в отчуждаемом, разумеется доли с семьей, а не чужим дядькой, что невозможно в случае этих детей.
Это практич. нереализуемо, опекуны не будут этим заниматься, и доплачивать из своих денег, чтобы детям купить по отдел. жилому помещению после продажи их долей в доме.
Надо было про это все соображать вшему "мужу", прежде чем принимать решение о покупке доли у матери этих детей- своей бывшей сожительницы.
----------
Теперь ждать совершеннолетия старших детей, чтобы их доли отчуждать без согласия опеки и законного представителя, если дети захотят отчуждать.
И если сами жить не хотят ваш "муж" с этим млад. ребенком и Вы,
то как вариант- сдать дом по дог. найма,
опять с согласия опекунов старших детей и опеки, и опекунам деньги от найма за доли детей, чтобы на нужды стрш. детей.
Т. е прикопал понапрасну деньги ваш "муж", покупая долю в этот проблемном доме.
-----
Мысли надо в горсть и писать толком, а не крошить батон невнятно.
И не надо сожителя называть гражданским супругом.
-------

Если вы не в курсах, то зачем вообще лезете в эту историю?

Доли детей продолжат оставаться в собственности детей, "оформить" их доли только на одного ребенка нельзя. Долей матери распоряжается мать. Хочет продаст, хочет подарит младшему.

Доли детей останутся у них. Продать их можно будет только с разрешения органа опеки с обязательным предоставлением им равноценного жилья.

Имущество, купленное с использованием мат. капитала, оформляется в долях на всех членов семьи. В данном случае мама является собственницей доли в доме. Поэтому лишить ее права собственности на ее долю власть права не имеете.