сможет ли перезимовать дома на окне можжевельник?

Дома на подоконнике, где снизу расположены батареи, вряд ли перезимует... сухой воздух и элементарно жарко.
В первую очередь вы не указали в вопросе, что нет сейчас возможности пересаживать на улицу... только в комменте... а это не все читают))
По советам о пересадке на улицу... это скорее не к вам... не ваш вариант... лично я бы не стала утверждать, что нормально успеет укорениться... разве. что в южных регионах. В других регионах в любой момент могут начаться заморозки... о каком укоренении речь?))
Мой совет... если хотите, чтобы растение дожило до весны, то ищите место с минимальной ПОЛОЖИТЕЛЬНОЙ температурой и повышенной влажностью воздуха... чем выше температура, тем влажность ВОЗДУХА должна быть выше... иначе растение начнет засыхать. Если на вашем застекленном балконе температура зимой не опускается ниже примерно минус 5 гр., то можно укутать горшок, чтобы корни не промерзли... корневая система в данном случае это самое важное, так как наземная часть выдержит и морозы. А, если холоднее, то придется искать другое прохладное, но не промерзающее место.

Растение уличное ДОма ему жарко Пусть в земле растет

Лучше высадить в сад, Еще успеет нормально укорениться, в зиму такую кроху легко можно укрыть. отличное средство для укрытия-листья дуба или клематиса. Они сами не гниют, но хорошо греют. Можно лутрасилом в несколько слоев. только не прям на кустик, а сделать что то типа арки.

Зачем ему зимовать-то дома, если он прекрасно растёт в саду и переносит морозы ого-го какие???? Высаживайте, а в вашем случае - переваливайте из горшка в открытый грунт, пока действительно не наступили лютые холода.

он может прекрасно перезимовать в саду, если его сейчас посадить. А в квартире, над батареей отопления, ему будет сложно перезимовать. Ему зимой холод нужен, а не плюсовая температура.

Нет, хвойным нужна "зима". На балкон выставите.

У меня зимовал можжевельник и туя. Но был случай, когда вдруг наступила зима, и землю совсем было уже не копнуть. Если копается, я бы высадила в грунт.
Дома- сухая зимовка, стояли на кухне, вместе с кактусами. Опрыскивание вместо полива. Да и на кухне воздух влажный, готовила много.
Ваш я бы перевалкой в побольшую емкость перевалила, уж очень корни близко к краю.

Вероятно да, если будет стоять в том месте, где часто проветривается (есть прохладный воздух).
Я бы сделал дырочки в стакане прокаленной спицей, высадил на улицу, и накрыл бы деревянным ящиком с отверстиями (щелями).
http://domir.ru/1rastenia/?file=mojevelniik1.php

да, если у тебя стеклопакет.