Посадил семена на рассаду. Обязательно дно протыкать? И после полива накрыл пленкой .Не сгниют? (чайник)

Прокалывать дно - не обязательно. Желательно, конечно... но не обязательно. Эти отверстия нужны для стока лишней воды (но совершенно нет нужды устраивать болото для растений).
НО некоторые растения после всходов нельзя поливать поверх, строго через поддон (это, например, петунии, эустома, и все прочие растения с мелкими и нежными всходами - да их и сеют-то по поверхности, не закапывая). Для таких растений отверстия в дне - жизненно необходимы.

А вот про пленку... вот вы же не ходите белье стирать на речку. У вас машинка для этих целей есть. Вот и для выращивания рассады парнички с крышкой есть. Я очень плохо отношусь к пленкам всяким. Они постоянно ложатся на почву и портят всходы.
Ну если в ваши планы приобретать парничок не входит - то хотя бы наделайте отверстий для дыхания растений в этой пленке, и поставьте под нее какие-нибудь пластиковые колышки (типа трубочек для сока, или ложечек 1-разовых для кофе)

Вода не должна там застаиваться

Всё правильно сделали. Потом протыкать надо. Когда пересаживать будете.

можно и без дырок, но только поливать тогда очень аккуратно и без фонатизма надо, т. к. лишней воде деться будет некуда и корни, как достигнут дна, могут гнить начать.

какие семена, какая ёмкость... есть нюансы.

протыкать коробку не надо. Под пленкой и в теплн должны быть до появления первых петелек. Потом пленку снять и в самое светлое место, желательна подсветка

правильно всё, только заглядывайте утром и вечером, как увидите всходы-пленку снимите.