Будут ли болеть пальцы из-за хруста?

Будут. Даже не сомневайтесь.
Ничего страшного не будет, ели похрустеть пальцами изредка. Другое дело, если делать это постоянно. Дело в том, что в результате таких действий изнашивается поверхность суставов, а с возрастом, когда ослабевает связочный аппарат, могут возникнуть и небольшие подвывихи. Также может произойти защемление нервных окончаний, в результате которого возникнет воспалительный процесс в тканях. Ортопеды не рекомендуют хрустеть пальцами на руках ещё и потому, что может развиться артрит. Постоянные или периодические травмы хряща могут спровоцировать развитие этого заболевания. Если есть такая привычка, то лучше заменить её на разминку. Это будет гораздо полезнее. Максимальное сгибание и разгибание кисти рекомендовано особенно с возрастом, когда у людей развивается «скрюченная» ладонь: как будто в руках вы держите яблоко. Пальцы искривляются, становятся узловатыми и негнущимися. Всё это следствие запущенной стадии артроза кистей рук. Поэтому движения на разгибание и сгибание будут очень полезны в таком случае.
Делайте выводы.

Хруст - это звук, от него ничего не будет. Будет от трения суставов.

когда нибудь ты их просто сломаешь и их придется ампутировать

Эта привычка пройдёт вследствие её бессмысленности.

А як же

Не правда. Я хрущу ими с детства. А сейчас мне 46 лет. Так говорят для того, что хруст просто раздражает тех кто рядом это слушает.
Мне даже говорили в детстве что пальцы станут толстые от этого. Но и это не правда!

Нет. Нечего не будет

Нет