По каким основаниям можно признать регистрацию ТСЖ недействительной в суде?

Во первых, у Вас есть всего 6 месяцев для обращения в суд: только там Вы можете оспорить решение общего собрания собственников. ст. 46, ч. 6 ЖК РФ.
Во-вторых, ТСЖ создается СОБСТВЕННИКАМИ, и не важно кто и что кому должен передать: помещения в собственности военных? Следовательно, они вправе принимать любые решения как собственники. ч. 1 ст. 48 ЖК
В третьих: что Вы имеете ввиду, когда называете проценты? Количество собственников? Количество квартир? Площади квартир?

Здесь есть очень важный момент: голоса собственника считаются только от площади помещения (ч. 3 ст. 48 ЖК) следующим образом:

1) 1/ на общую (или полезную - неважно, т. к. итог будет в процентах, а процент от этого не изменится) площадь дома*100 = количество голосов в 1 кв. м.
2) полученное кол-во голосов в 1 кв. м. * на площадь, которая находится в собственности лица= количество голосов для принятия решений данного лица.

Таким образом, если окажется, что площадь всех квартир, находящаяся в собственности военных меньше, чем площадь оставшихся квартир, то Вы можете оспорить решение в Суде именно по этому основанию.
Кроме того, для того, чтобы решения вступили в силу нужно (ч. 4 ст. 45): предупредить под роспись КАЖДОГО собственника о собрании за 10 дней (даже если в Вашей квартире 4 собственника, по 1/4, то предупреждать нужно каждого) или заказным письмом;
Такое предупреждение должно соответствовать требованиям ч. 5 ст. 45 (посмотрите сами, там требований много, но все они обязательно должны быть в Сообщении о проведении общего собрания) .
Если такого сообщения не получили многие собственники, то можно делать вывод, что решение такого собрания не может вступить в силу, а значит регистрация ТСЖ незаконна.

И еще: для того, чтобы ТСЖ существовало, необходимо чтобы заявление о вступлении в него написало большинство собственников (не количество человек, а голосоа по схеме, указанной выше) . Т. е. , если прошло более 6 мес. и нельзя оспорить принятое решение, а голосов у военных окажется меньше, то данное ТСЖ можно ликвидировать в судебном порядке и по этому основанию (ч. 2 ст. 141 ЖК РФ) .

А вообще, ТСЖ - это хорошая тема. По закону № 185 "О фонде содействия реформированию ЖКХ" Вы имеете шанс получить немалые средства на капитальный ремонт дома, если Ваш город выполнит все 12 условий данного закона; Вы можете стать членом правления и решать важные вопросы, Вы можете стать членом ревизионной комиссии и контролировать все приходы и расходы и т. д.

Если что-то непонятно или не доконца объяснила - пишите.

Врядли Вы в нете найдете ответ на этот вопрос.
Военные дожны были передать или передали?
Вы в приципе можете не пользоваться услугами ТСЖ, а сами заключить договоры со службами (электроэнергия, газ и т. д. и с тем, кто отвечает за состояние жилья, т. е. ТСЖ (раз уж его зарегистрировали)).