Может ли собственник квартиры выписать несобственника без его согласия ?

по решению суда можно снять с регистрационного учёта....

Вам придется обратиться в суд с иском о признании этого гражданина утратившим право пользования жилой площадью. И только после решения суда снять его с регистрации (а не "выписать", ибо прописки давно уже нет)

На основании п. 4 ст. 31 ЖК РФ по решению суда, при условии, что у НЕ СОБСТВЕННИКА нет законных прав пользования этой жилой площадью.
Статья 31. Права и обязанности граждан, проживающих совместно с собственником в принадлежащем ему жилом помещении
4. В случае прекращения семейных отношений с собственником жилого помещения право пользования данным жилым помещением за бывшим членом семьи собственника этого жилого помещения не сохраняется, если иное не установлено соглашением между собственником и бывшим членом его семьи. Если у бывшего члена семьи собственника жилого помещения отсутствуют основания приобретения или осуществления права пользования иным жилым помещением, а также если имущественное положение бывшего члена семьи собственника жилого помещения и другие заслуживающие внимания обстоятельства не позволяют ему обеспечить себя иным жилым помещением, право пользования жилым помещением, принадлежащим указанному собственнику, может быть сохранено за бывшим членом его семьи на определенный срок на основании решения суда. При этом суд вправе обязать собственника жилого помещения обеспечить иным жилым помещением бывшего супруга и других членов его семьи, в пользу которых собственник исполняет алиментные обязательства, по их требованию.
5. По истечении срока пользования жилым помещением, установленного решением суда,

Да если этот человек не прописан там с ребенком.

только через суд

Да, может. В крайнем случае- по постановлению суда, но это 100% решение в пользу собственника.

Через суд - запросто