Какое наказание влечёт сокрытие 13% налога с продажи кв-ры? При разберательстве в суде.

А чем хочет в суде продавец мотивировать желание вернуть квартиру?
Тупая отмазка "Я передумал" тут не прокатывает.

Нужны очень веские причины, чтобы признать договор недействительным. Продавцу грозит штраф в размере от 20 до 40% от неуплаченной суммы налога, люс пени в размере 1/300 ставки рефинансирования за каждый день просрочки уплаты налога.
Статья 198 УК РФ. Уклонение от уплаты налогов и (или) сборов с физического лица
1. Уклонение от уплаты налогов и (или) сборов с физического лица путем непредставления налоговой декларации или иных документов, представление которых в соответствии с законодательством Российской Федерации о налогах и сборах является обязательным, либо путем включения в налоговую декларацию или такие документы заведомо ложных сведений, совершенное в крупном размере, -
наказывается штрафом в размере от ста тысяч до трехсот тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период от одного года до двух лет, либо арестом на срок от четырех до шести месяцев, либо лишением свободы на срок до одного года.
Примечание. Крупным размером в настоящей статье признается сумма налогов и (или) сборов, составляющая за период в пределах трех финансовых лет подряд более ста тысяч рублей, при условии, что доля неуплаченных налогов и (или) сборов превышает 10 процентов подлежащих уплате сумм налогов и (или) сборов, либо превышающая триста тысяч рублей,
Конечно, продавец будет в проигрыше, ну а отношении вас - как дело повернется,
Статья 169 ГК РФ. Недействительность сделки, совершенной с целью, противной основам правопорядка и нравственности
Сделка, совершенная с целью, заведомо противной основам правопорядка или нравственности, ничтожна.
При наличии умысла у обеих сторон такой сделки - в случае исполнения сделки обеими сторонами - в доход Российской Федерации взыскивается все полученное ими по сделке, а в случае исполнения сделки одной стороной с другой стороны взыскивается в доход Российской Федерации все полученное ею и все причитавшееся с нее первой стороне в возмещение полученного.
При наличии умысла лишь у одной из сторон такой сделки все полученное ею по сделке должно быть возвращено другой стороне, а полученное последней либо причитавшееся ей в возмещение исполненного взыскивается в доход Российской Федерации.
И надо было Вам связываться?

Чем мотивирует Ваш продавец? Самое интересное, что оба договора у Вас по сделке равны между собой. Только один удостоверен у нотариуса, а другой нет. Один прошёл через регистрацию в ФРС, а второй остался между Вами не зарегистрированным, но отражает реальную картину. Но по второму договору есть расписка от продавца о том, что он получил от Вас эти деньги? Если её нету, то у Вас только договор, а без расписки это не доказательство существования сделки. Припугнуть его можно тем, что может сесть за уклонение от уплаты налогов, но и Вы подписав такой фиктивный договор также способствовали этому, то есть и Вас не минует чаша сия.
Так что надо узнать, чего хочет тот уважаемый тип, который является Продавцом.

Если сделка нотариальная, а договор зарегистрирован в ФРС проблемно будет продавцу что-то доказать

непонятная ситуация - либо продавец обмануть хочет, либо нашел более выгодного покупателя. Если сделка нотариальная, а договор зарегистрирован в ФРС проблемно будет продавцу что-то доказать