Беременная выписывается из квартиры.

Прописка, а точнее регистрация по месту жительства - является подтверждением фактического места жительства. Если данная женщина заново сможет жить в трех-комнатной квартире, то сможет там и зарегистрироваться. Ребенок после рождения будет зарегистрирован по месту жительства матери.

Подобные советы и действия обычно связаны с приватизацией жилых помещений - либо родня хочет приватизировать 3-х комнатную квартиру и оставить женщину ни с чем, либо женщина хочет приватизировать комнату в коммуналке.

Если же и 3-х комнатная квартира и комната в комуналке уже в собственности, то вызывает вопросы о целесообразности подобные выписки.

Подробнее, о том как выписывать, причинах и документах можете почитать в нашем материале - Как выселить бывшего члена семьи - https://socpravo.ru/kak-vyselit-byvshego-chlena-semi/ . Он хоть и написан с точки зрения выселения, но его можно применить и для защиты от подобных выселений ))

В общем читайте и задавайте вопросы

В каком статусе квартира? Кто собственник?

Нет, нельзя. Новорожденный регистрируется по месту регистрации своих матери или отца . Если ни мать и ни отец в этой трешке не зарегистрированы, то и ребенка там зарегистрировать невозможно.
Если беременная не просто была зарегистрирована в квартире, но и являлась её сособственником, то она может зарегистрироваться в этой квартире снова и впоследствии зарегистрировать своего ребенка.

Женщина может зарегистрировпться обратно только с согласия всех собственников ( нанимателей) Ребенок должен быть зарегистрирован с одним из родителец

Ребенок может быть зарегистрированным только с кем-то из родителей.

а может её в коммуналке на очередь поставят после родов

какая-то ушлая родня