непрерывность стажа.

Наташа, Ваш вопрос касается получения надбавок за стаж непрерывной работы в медицинских учреждениях. Я сам, работал на станции скорой медицинской помощи в администрации, получал эти надбавки.
Непрерывный стаж для получения надбавок в системе Минздрава РФ сохраняется, если перерыв в работе не превысил одного месяца.
Стаж непрерывной работы сохранялся за работником, если работник увольнялся из предприятий (структурных подразделений) независимо от форм собственности, осуществляющих в установленном порядке функции учреждений здравоохранения, при условии, если за указанным периодом работы непосредственно предшествовала работа в учреждениях здравоохранения и социальной защиты населения (приказ Минздрава РФ от 24.04.2003 года № 160 п. 4.2.). К настоящему времени этот приказ Минздрава РФ отменен. Однако, действует и применяется иной нормативно-правовой акт «Положение
о порядке исчисления стимулирующих выплат за продолжительность непрерывной работы в учреждениях здравоохранения» , которое является Приложение N 5 к Примерному положению об оплате труда работников федеральных бюджетных научных учреждений, имеющих в составе клинические подразделения, подведомственных Министерству здравоохранения и социального развития Российской Федерации, утв. приказом Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 28 августа 2008 г. N 463н. Ваш вопрос в этом Положении регулируется п. п. 2.2.1 – 2.4.
Поэтому медицинский стаж, необходимый для получения надбавок, у Вас прервался.
В настоящее время перед Вами может стоять вопрос о восстановлении непрерывности этого стажа.
Решение вопроса о восстановлении стажа непрерывной работы работникам федеральных учреждений здравоохранения осуществляется на уровне Минздравсоцразвития России совместно с ЦК профсоюза работников здравоохранения РФ в ранее установленном порядке.
В соответствии с Законом от 22 августа 2004 года № 122-ФЗ «О внесении изменений в законодательные акты РФ и признании утратившими силу некоторых законодательных актов РФ в связи с принятием федеральных законов» . внесены изменения в статью 143 ТК РФ «Об общих принципах организации местного самоуправления РФ» .
В соответствии с абзацем 4 указанной выше статьи, тарифная система оплаты труда работников муниципальных учреждений и порядок ее применения осуществляется органами местного самоуправления.
На практике в настоящее время каждое муниципальное образование субъекта федерации издает свои нормативные акты, регулирующие вопросы оплаты труда бюджетников, в том числе, и вопросы регулирования оплаты труда работников медицинских учреждений.
Исходя из изложенного следует, что решение вопроса о восстановлении стажа непрерывной работы, дающего право на получение надбавки за продолжительность непрерывной работы в учреждениях здравоохранения, относится к компетенции органов управления здравоохранения субъекта РФ.
Изменение размеров надбавок за продолжительность непрерывной работы производится с момента наступления срока стажа, если документы, подтверждающие непрерывный стаж, находятся в учреждении, или со дня представления работником необходимых документов, подтверждающих непрерывный стаж.

Может быть я не права, но ведь вы все время работали медицинским работником, как же у Вас прервался медицниский стаж. Думаю, что Ваш начальник не и прав. Но лучше обратитесь по этому вопросу, если никто больше не ответит, к спеуиалисту (юристу) в юридическую консультацию. Там Вам дадут исчерпывающий ответ