директор сдает недвиж. имущ. нашему предприятию как ИП, но дог.аренды оформил на гл. бух по довер, типа юристы не разреш

В Вашем случае директор (допустим его ФИО – Иванов И. И. ) Вашей организации НЕ является арендатором и стороной в сделке.
Арендатором (и стороной в договоре) является Ваша организация, хотя и в лице директора Иванова. (при этом директор Иванов является НЕ ПРЕДСТАВИТЕЛЕМ оганизации-Арендатора, а ее ОРГАНОМ, поэтому п. 3 ст. 182 ГК РФ к таким ситуациям неприменим. Об этом масса судебной практики, в т. ч. ВАС РФ – Определение от 03.09.2008г. N 11092/08, Определение от 19.12.2007г. N 14573/07, Постановление от 11.04.2006 г. N 10327/05).
Другая сторона договора – ИП Иванов, как арендодатель.
Т. е. стороны сделки (организация и ИП) не совпадают, это разные субъекты.
Но это ОДНОЗНАЧНО сделка с заинтересованностью (со стороны директора, т. к. он как ЧП является стороной сделки) , т. е. она должна была совершаться директором на основании решения уполномоченного органа Вашей организации (правда Вы не указали ее ОПФ) .
На пример, для ООО – на основании решения общего собрания участников ООО или последующего ее одобрения собранием участников (ст. 45 ФЗ "Об ООО"), при этом директор, если он тоже участник ООО, в голосовании не участвует.
Если это условие не соблюдено, то эта сделка МОЖЕТ быть признана НЕДЕЙСТВИТЕЛЬНОЙ по иску участника ООО.
Но пока эта сделка (договор) в судебном порядке не оспорена, она ДЕЙСТВИТЕЛЬНА.
Для АО – подход аналогичен, для Унитарного предприятия – сделка должна быть одобрена собственником имущества предприятия.
А вот игрища с доверенностью, выданной директором, (хоть на главбуха, хоть на другого сотрудника и даже на любое постороннее лицо) НИЧЕГО не меняют, т. к. это все равно сделка с заинтересованностью со стороны директора, являющегося как ИП, стороной в сделке – арендодателем.
И с точки зрения налоговой – сделки с заинтересованностью НЕ ЗАПРЕЩЕНЫ, важно только отсутствие отклонений от рыночной цены, в размере более допустимого.
Удачи.

Конечно, сделка может быть налоговиками определена как "экономически нецелесообразная" или с заинтересованностью. Ваша задача будет - доказать, что гендир - это исполнительный орган, а не физ лицо ИП. Но право подписать договор гендир (если Устав позволяет ему передавать такие полномочия) по доверенности может передать своим заместителям.