При проверке гос. учреждения выяснилось отсутствие колл. договора. Юрист учреждения утверждает, что он не обязателен. -?

Юрист, конечно, прав. И ТК РФ на прямукю не обязывает заключения коллективного договора. Но если внимательно вчитаться в статьи ТК РФ, то их наберется около соти, которые в той или иной мере отправляют регулирование трудовые отношений к коллективному договору. Например, статья 136 ТК РФ об установлении сроков выплаты заработной платы. Конечно, можно прописать и в трудовом договоре. Но ведь это условие касается для все коллектива, есть смыл прописать это в одном месте и знакомить вновь поступающих работников под роспись. Или условия стимулирования. Поэтому, о наличии коллективного договора стоит и задуматься.

правильно утверждает, ст. 40-41 тк рф

Действительно так.

юрист прав

Юрист прав, но не только по статьям 40-41 ТК РФ. Для гос. учреждений ВСЕГДА на сегодняшний день существует Отраслевое соглашение между Руководством отрасли и Профсоюзом этой отрасли как правило на три года .(например, "Отраслевое соглашение между профсоюзами гражданского персонала Вооруженных Сил Российской Федерации и Министерством обороны Российской Федерации на 2011 - 2013 годы" или "Отраслевое соглашение между Министерством культуры РФ и Российским профсоюзом работников культуры на 2012 - 2014 годы" (утв. Минкультуры РФ, Российским профсоюзом работников культуры 18.11.2011) .
Эти Отраслевые соглашения регулируют трудовые отношения между работодателями и работниками. Поэтому в общем нет необходимости заключать кол. договор в организации, тем более, если там нет профсоюзной организации ( и такое бывает) и нет комитета с представителями работников. И потом, заключение кол. договора должно быть инициировано или со стороны работодателя или со стороны работников организации. Если ни того, ни другого нет, то и заключать нет надобности.