В чем же загадка Онегина в романе Александра Сергеевича Пушкина "Евгений Онегин" ?

В том, что главный персонаж романа Татьяна, а не Онегин. Онегин напыщенный франт, обложившийся умными книгами, но ничего в них не поняв.

И снова, преданный безделью,
Томясь душевной пустотой,
Уселся он - с похвальной целью
Себе присвоить ум чужой;
Отрядом книг уставил полку,
Читал, читал, а все без толку:
Там скука, там обман иль бред;
В том совести, в том смысла нет;
На всех различные вериги;
И устарела старина,
И старым бредит новизна.
Как женщин, он оставил книги,
И полку, с пыльной их семьей,
Задернул траурной тафтой.

Он рыться не имел охоты
В хронологической пыли
Бытописания земли:
Но дней минувших анекдоты
От Ромула до наших дней
Хранил он в памяти своей.

Он по-французски совершенно
Мог изъясняться и писал;
Легко мазурку танцевал
И кланялся непринужденно;
Чего ж вам больше? Свет решил,
Что он умен и очень мил.

Он только создаёт вид приличного человека, на самом деле пустышка, один из бездельников, прожигающих жизнь. А Татьяна, прочитав те книги после отъезда Онегина, совершенно преобразилась, потому она стала женой не Онегина, она выше его.

Попробуйте послушать передачи Михаила Казиника о романе и опере "Евгений Онегин".
На интернете много записей Казиника разных лет, вот некоторые:

http://88.208.53.178/storage/Михаил Казиник Тайные знаки культуры Евгений Онегин 1

http://88.208.53.178/storage/Михаил Казиник Тайные знаки культуры Евгений Онегин 2

http://www.muzcentrum.ru/orfeus/programs/program21/page21.html