Почему у живых существ разный способ рождения? В этом есть какой-то духовный смысл?

Всё идёт от Бога!
Ему сверху видно всё -
Ты - так и знай!

Разный способ зависит от материального тела.

все рождаются из яиц, просто одни особи носят мягкие яйца в себе, а другие высиживают затвердевшие яйца снаружи
,как говорят про месячные у женщин: вышла неоплодотворенная ЯЙЦЕклетка

Смысл (если можно вообще говорить о наличии какого-нибудь смысла) - в реализации божественного замысла, который в рамках существования жизни на Земле – есть часть общего эволюционного процесса сознания (если хотите божественного сознания ил святого духа – не принципиально ибо это вопрос терминологии) в процессе которого на этапе инволюции (погружения его в материальность – т. е. в процессе его уплотнения (упаковывания) в более плотные материальные формы) ) творил, создавая в этом процессе различные формы проявления жизни. Все это было заложено на «нисходящей дуге эволюции» в процессе погружения в материальность. Сейчас, в определенный период своего проживания человек видит результаты Его творчества в каком-то текущем на данный момент времени развития – разнообразии живых форм (в т. ч. животного царства) .
На восходящей дуге эволюции (в процессе просветления материальности) эволюционный процесс будет идти закономерно (согласно) тому – что было уже заложено в него на нисходящей дуге – т. е. будет идти «узким путем» к возврату в Лоно Отца, но уже с приобретением эволюционного «опыта» сознательного существования всего живого. «Главным действующим лицом» (он же средство, он же зритель, он же исполнитель) будет (и уже является в лице некоторых немногочисленных представителей) – человек, как «вершина эволюционного замысла на Земле» - как «ключевое переходное эволюционное звено» . Посредством него (как физического носителя плотноматериальной формы – животного тела) с одной стороны и «истинной Души» , которая на тонком плане является (свободной – «неупаковонной» сама по себе) - непосредственно единой частью с Духом Святым в сотворчестве с Ним и будет создавать (и уже создает, ибо процесс возврата уже идет) новую Землю, Нового Человека и Новые Небеса, о которых Возвестил две тысячи лет назад Иисус Христос…

ЯЙЦЕклетка так называется потому что на форме она напоминает яйцо.

Почему одни рождаются из яйца, а другие из утробы - потому что это предусмотрено природой. Все что вышло не из яйца - это МЛЕКОпитающие. Потому что питаются МОЛОКОМ матери. У самок предусмотрено наличие молочных желез для вскармливания ребенка. Так же находясь в утробе, зародыш получает питание на счет пуповины. Находясь с яйце питается только микроэлементами находящимися внутри яйца.
Духовный смысл наверно заложен в образе жизни того или иного животного.