Ответьте с научной точки зрения! С каким цветом глаз было коренное население земли?

Коричневый "по умолчанию" является цветом человеческих глаз, возникающим под воздействием темного кожного пигмента - меланина.

Китайцы, что ли? Ну тогда узкоглазые...

С карим. Почему? Потому что, по теории антропогенеза, вид Homo Sapiens возник в тропических широтах.
В тропических широтах слой атмосферы, через которой проходит ЭМ излучение Солнца, мал. В результате ЭМ волны меньше рассеиваются на молекулах этого слоя, чем, например, в умеренных широтах. А потому риск приобрести злокачественные заболевания больше, чем на более высоких широтах. Защитным механизмом от приобретения злокачественных заболеваний есть меланин, пигмент, который поглощает ЭМ излучение. Карие глаза, как и темная кожа, характеризуются повышенным содержанием меланина.
Поэтому негроидная раса в основном имеет темную кожу и темные (карие) глаза. Потому изначально карий цвет глаз был доминантным признаком. Особи, у которых несколько аллелей, ответственных за пигментацию радужных оболочек глаз, мутировали, в результате чего цвет оболочки глаза стал мене темным, отсекались естественным отбором в результате возникновения болезней.
Но при расселении человека по различным местам земной поверхности темный цвет глаз перестал быть основополагающим. В результате, множество людей сейчас имеют не карие глаза. Соотношение количества людей со светлым цветом глаз, что соответствует малому количеству меланина в радужной оболочке, к количеству людей с темным цветом глаз, увеличивается с увеличением широтности.

Точно не знаю, но мое мнение что с карими, потому что этот цвет глаз доминирует на голубым цветом глаз (рецессивным)