Профессор физики сказал мне, что частиц как таковых не существует и что атомы по сути своей - волны.

А я скажу вам совершенно точно: Профессор ПРАВ!!!
В этом мире всё на волнах зиждется. Только я бы добавил: на разных эфирах.

Такие профессоры в глубоком маразме не редкость, и показатель нашей науки

Точно вам никто не скажет, нет еще приборов способных увидеть в таком масштабе. Есть только теория, которая может быть неверной.

Он пошутил, что профессор.

Если эфиром обозвать многомерное пространство, в котором колеблются браны,
то в целом не особо и пошутл.
Нормальная такая теория струн в изложении для детей школьного возраста

Наверное, это был профессор литературы

Физики, не сумев найти грань между частицами (веществом) и волнами (энергией), по-просту зачислили энергию в разряд НЕматерии (абстракции, условности). Теперь настала очередь проделать это-же с веществом... Со временем всё наше бытие окажется абстракцией (у них). В чём-то они будут и правы..., но будет-ли это истиной (в нашем мире)?

Абстракция порождает абстракцию (что, впрочем, и должно быть). Но если абстракции не переводить на действительную (нашу) материю (т. е. не переводить формулы на простой и понятный язык действительности), то абстракции всё дальше будут удаляться от действительности (нашей), будут создаваться (условно, до действительности они не дойдут) миры, которые не будут именно нашей действительностью (но я не утверждаю, что таких миров не может быть, где-то). Просто физики станут "изучать" миры, которые МОГУТ существовать (и я их не отрицаю), но (учитывая многообразие таких возможных миров) совсем необязательно, что наш, действительный мир, именно такой, какой "смоделируют" они.
Нечто подобное уже было, с системой мира по Птолемею...

По-моему эфир наукой не принят. И если он профессор научный, значит он пошутил.
А уж как там на самом деле - хрен его знает.

всё верно сказал

Поведение частицы можно описать волновым уравнением - тут профессор не шутил (см. "солитон")

Ну, спроси у него сам, если чего не понял)