Фотоны, проходящие через воду, замедляются, а затем снова ускоряются? Куда уходит их энергия и откуда добавляется вновь?

Лишняя энергия трансформируется в эффективную массу (дефект масс). При вылете фотон эту массу теряет, так как нет взаимодействия с молекулами воды.
Наличие массы у фотона в веществе приводит к уменьшению его скорости.

Поглощаются и переизлучаются молекулами воды. Между молекулами летят с обычной скоростью, как в вакууме.

В водной или стеклянной среде электрическая жёсткость пространства меньше. Поэтому ударная электрическая волна распространяется медленнее.

Для луча света пустота похожа на сталь, а стекло - на желе или холодец.

При ударе в торец стального прутка дрожание стали минимально, а скорость ударной волны большая. При переходе этой волны в желе оно раскачивается шире, а скорость движения вперёд меньше

Как-то так)

Причина в том, что вещество - это каша из положительных и отрицательных зарядов. Когда в неё влетает фотон, эта каша начинает болтаться. И выплыть из неё получается долго.

Если мы приложим стеклянную линзу к уху, то услышим, как матюкаются прорывающиеся через неё фотоны. Особенно, если стекло тяжёлое, например, с добавкой свинца

))

Фотоны не ходют.
... тем более не ускоряются.
А скорость электромагнитных волн зависит от диэлектрической и магнитной проницаемости среды распространения.

Никуда не уходит. Она зависит только от частоты.

верно. уходит на нагрев воды. и не откуда не берётся иначе не было бы преломления да и фотон это субатомная частица (волна. он просто затухает а те частицы которые получают импульс после прохождения светом преграды просто получаю меньший импульс что мы будем воспринимать как снижение яркости. Магия тут в том что как что-то может передать импульс и энергию сквозь миллионы километров практически полной пустоты?

Такие вот дела

Фотон в воде движется от молекулы к молекуле с такой же скоростью, как и в вакууме, а, замедляется фотон потому, что молекулы могут фотон поглощать и немного его в себе попридержать. Вылетая из поверхности воды фотон сохраняет свою обычную вакуумную скорость.

погощение и переизлучение, т.к. их энергии недостаточно для перехода электронов на новый постоянный энергетический уровень

Что ещё можно сказать? В школу все вроде ходили...

фотон - это электромагнитный импульс, поэтому рассматривай процесс распространения ЭМ-волн.

фотоны обладают нулевой массой покоя и, следовательно, не могут иметь скорости, отличной от скорости света. это значит, что в среде они не могут замедляться. Они либо поглощаются, либо рассеиваются, причем в основном на большие углы

считают что ты пытаешься пройти через людей, вот так же Фотоны пытаются пройти через Элемент воды

То что ты видишь это не замедление света, и не переизлучение, это всё сделано что бы тебе это было легче понять, фотон не может замедлиться или ускориться и не может приобрести массу это основа частицы фотона 0 массы и 1 спин и 0 заряда (смотрите стандартную модель), но энергия не нулевая потому что это и есть переносчик электромагнитного взаимодействия, а так же фотон обладает импульсом (иначе бы он образно говоря не понимал куда лететь) поэтому из-за импульса и энергии в нем он может нагревать и толкать (E=mc² объясняет почему он имея нулевую массу может толкать, закон сохранения импульса так же в этом помогает, короче энергия переходит в скорость и нагрев так как сам фотон исчезает), в общем вот главный ответ на вопрос это просто (вообще не просто) наложение одной волны света на другую, то есть когда свет проходит через вещество оно вроде как (я сам не особо понимаю) заставляет частицы этого вещества своим возмущением электромагнитного поля делать такое же возмущение электромагнитного поля так как они начинают колебаться, но с небольшой задержкой и из-за этой задержки сумарное 2 волн и порождает "замедление" света, более подробно об этом объяснено на ютуб канале "Физика от Побединского" видео "Можно ли ОСТАНОВИТЬ СВЕТ?" с иллюстрациями для более хорошего понимания процесса
Зачем я это сказал объяснил и пояснил? потому что увидел какой бред чел с ником "Пришелец" тебе впаривает и меня сгорело, нет массы у фотона, нет, не было и не будет никогда ни при каких обстоятельствах, это основа, запомни её