Декретный отпуск

сотрудника А должны были принять по договора подряда без зачисления в штат, иначе это ошибка если она была принята по ТК. Уволить до 3х лет не имеете права, если сотрудница была А оформлена по ТК и подписала трудовой договор.

Для начала изучите ст. 261 ТК РФ. Там четко сказано, что по истечение срока договора можно и беременную уволить. Гарантия сохранения рабочего места и должности на "срочников" не распространяется. Если у вас основной работник вышел на работу, то временного вы обязаны уволить, даже если она в отпуске по БиР или по уходу (ст. 79 ТК РФ)
Нельзя увольнять декретницу по ст. 81 (инициатива работодателя) , это совершенно конкретно сказано в ст. 261, последний параграф, а срочный договор - это другая история, и другая статья ТК РФ (79)
Если вы её не уволили по истечнии срока договора, то договор стал бессрочным, теперь её так просто не уволить.
ст. 58 ТК РФ В случае, когда ни одна из сторон не потребовала расторжения срочного трудового договора в связи с истечением срока его действия и работник продолжает работу после истечения срока действия трудового договора, условие о срочном характере трудового договора утрачивает силу и трудовой договор считается заключенным на неопределенный срок.

В общем, берете все приказы о приеме/увольнении, договора, трудовой кодекс и пытаетесь собрать всё воедино. Можете в гос. труд. инспекции проконсультироваться, чтобы потом по судам не бегать.