
История Самары уходит в глубокую древность.

По одному из преданий, святой Алексей, митрополит Московский, в 1357 году во время путешествия по Волге остановился у устья реки Самары и предсказал, что "будет воздвигнут тут город великий, в котором просияет благочестие и который ни какому разорению подвергнут не будет": С тех пор святого Алексея считают покровителем самарского края.

Самар по средневековым итальянским картам известна с середины XIV века (1367) и оставалась поселением-пристанью до 1521г. А через 65 лет после разорения русского поселения-пристани Самар в 1568 году царь Федор Иванович приказал возродить у вершины Самарской Луки "за много лет запустеша" русское поселение Самару. Так на Средней Волге, у вершины Самарской Луки, в двадцати верстах от древнего поселения-пристани Самар, центра рыбацкой и казацкой деятельности, был построен государев город-крепость Самара. Самара на Средней Волге как поселение

В строительстве Самарского городка принимал участие стрелецкий голова Федор Елизарьевич Ельчанинов.

Для Самарского городка было выбрано место в двух верстах от Волги, но на возвышенном, тактически выгодном мысе правого берега реки Самары. Так на Средней Волге, у вершины Самарской Луки, в двадцати верстах от древнего поселения-пристани Самар, центра рыбацкой и казацкой деятельности, был построен государев город-крепость Самара.
Ещё один вариант
Свое название город Самара получил от названия реки. Существует несколько версий происхождения названия реки.
Самара. Согласно самой распространённой версии, купцы, поднимавшиеся вверх по полноводной Волге (в древности Ра - Итиль) по ошибке заплыли в приток, который по величине был соизмерим с основным руслом Ра. Когда же ошибка выяснилась, эту реку стали называть Самара (сама + Ра) , в дальнейшем трансформировавшеюся в Самара.
Однако эта версия не выдерживает критики, т. к. река под таким названием была известна задолго до появления здесь русских. В 922 году нашей эры река под именем Самур упоминается в дорожных записках секретаря арабского посольства Ибн-Фадлана, чей караван переправлялся через нее на пути из Багдада в пределы Волжской Булгарии к булгарскому царю Алмушу. Это была именно та река, которая на Средней Волге уже много столетий носит имя Самара.

Впервые своим настоящим именем она названа в "Книге, глаголемой Большой чертеж", увидевшей свет в 1627 году. Однако еще в середине XVI века в 1562 году на карте англичанина Дженкинсона река обозначена как Самар. Вторая часть Самар - "Ар" - у народов востока обозначает реку, поток (арык) . Отсюда восточное происхождение. Самар прослеживается как "Сам + ар" - "степная река", "река знойных степей". В русской транскрипции - Самара.
http://gorod-samara.narod.ru/histori.html
http://govorite.blogspot.com/2011/07/blog-post_16
http://www.kvakino.narod.ru/samara/samara_istorija.htm