Можно ли чистить реестр через ссклинер?

CCleaner комп не угробит, конечно, но по моим субъективным ощущениям у него протоколы работы делают не совсем то, что нужно. Поэтому не рекомендую.
Если так уж хочется почистить реестр, то намного лучше RegOrganizer
..
От "Вредоносного ПО" Malwarebytes Anti-Malware. В описанном тобой случае ни RegOrganizer, ни тем более CCleaner в одиночку не спасут.
После проверки Malwarebytes Anti-Malware можно прогнать RegOrganizer
..
Это Malwarebytes Anti-Malware - в конце установки обязательно сними галочку с пробного периода полной защиты - оно не нужно и может из-за глюка начать жрать системные ресурсы. Используй просто для разовых проверок. Открываешь и сразу запустить проверку. При очистке может случайно снести активатор винды (если пиратка)
https://drive.google.com/file/d/1PMGgMUwViSz7y_tURmrNbGJqmsxmAgXO/view?usp=sharing
..
Это RegOrganizer - я в нём использую (и то очень редко) чистку реестра и чистку дисков. Для чистки нужна активированная программа. Ключ в комплекте в блокноте.
https://drive.google.com/file/d/1bQBjXY9Fn7TkO4JlutTf-0rA82jX_SF0/view?usp=sharing

CCleaner это вирус....

можно но не нужно.

да

нет..
еще больше забьешь говном..
переставь винду..

Всегда чищу, но во избежании ошибок, не надо чистить ActiveX/COM LocalServer32....бла бла бла. Около 15 лет пользуюсь, 10 лет ПК уже и всё летает Апекс или горизон зиро давн в 2к, гта на высоких тоже и всё это на fx 8300, главное как собирать и что собирать, а не покупать что подороже. В общем чисти, проблем не будет.

Можно