Где и как зарегистрировать свой логотип

Понятие "логотип" отсутствует в российском законодательстве, регламентирующим отношения в сфере интеллектуальной собственности.
Ответ на Ваш вопрос будет зависеть от того, для какой цели используется логотип:
- если для индивидуализации конкретного товара, то это будет товарным знаком (п. 1 ст. 1477 ГК РФ) , который подлежит регистрации в Роспатенте (Федеральной службе по интеллектуальной собственности, патентам и товарным знакам) (смотрите ответ Николаса Неизвестного) ;
- если логотип используется для обозначения Вашего предприятия в целом, то это будет не товарный знак, а коммерческое обозначение, не подлежащее какой-либо государственной регистрации.
В силу п. 1 ст. 1538 ГК РФ юридические лица, осуществляющие предпринимательскую деятельность (в том числе некоммерческие организации, которым право на осуществление такой деятельности предоставлено в соответствии с законом их учредительными документами) , а также индивидуальные предприниматели могут использовать для индивидуализации принадлежащих им торговых, промышленных и других предприятий (статья 132) коммерческие обозначения, не являющиеся фирменными наименованиями и не подлежащие обязательному включению в учредительные документы и единый государственный реестр юридических лиц.
Исключительное право на коммерческое обозначение (в отличие от исключительного права на товарный знак) возникает не в силу государственной регистрации в Роспатенте, а в силу самого факта начала использования такого коммерческого обозначения.
Как разъясняют Верховный суд РФ и ВАС РФ исключительное право использования коммерческого обозначения на основании п. 1 ст. 1539 ГК РФ принадлежит правообладателю, если такое обозначение обладает достаточными различительными признаками и его употребление правообладателем для индивидуализации своего предприятия является известным в пределах определенной территории.
В связи с этим следует учитывать, что право на коммерческое обозначение не возникает ранее момента начала фактического использования такого обозначения для индивидуализации предприятия.
По смыслу п. 2 ст. 1540 ГК РФ исключительное право на коммерческое обозначение прекращается автоматически, если правообладатель не использует его непрерывно в течение года (пункты 64 и 65 Постановления Пленума Верховного Суда РФ N 5, Пленума ВАС РФ N 29 от 26.03.2009 г. "О некоторых вопросах, возникших в связи с введением в действие части четвертой Гражданского кодекса Российской Федерации").

Вам правильно уже выше написали, регистрируется не логотип, а товарный знак. Я бы вам посоветовала, если нет особых знаний по этому вопросу, лучше обратиться к юристам. Мы сами регали тз через патентное бюро, вышло все не очень дорого и без особой головной боли. Обращались в Кривцов и партнеры, могу их рекомендовать.