беспроцентный займ ген.директору.

Эта сделка МОЖЕТ быть крупной, но согласие ВСЕХ участников нужно только, если это предусмотрено Уставом данного ООО, а по ФЗ Об ООО (ст. 37, 46) достаточно простого большинства.
Эта сделко ОДНОЗНАЧНО с заинтересованностью и нужно согласие большинства от ВСЕХ незаинтересованных участников (ст. 45 ФЗ Об ООО) . Директор, если он тоже участник ООО, в голосовании не участвует. Рассмотрение такого вопроса только по правилам сделок с заинтересованностью (без учета крупности) для ООО не предусмотрено. Такая особенность установлена только для АО.
Подписывать договор с обеих строн может и один человек, но в договоре должно быть отражено - с одной стороны, Заемщик - физ. лицо Иванов И. И. , с другой стороны, Заимодавец - ООО, в лице директора Иванова И. И. , действующего на основании Устава и ВО ИСПОЛНЕНИЕ решения собрания участников от ___ 2008г. (на котором участники все одобрили и поручили директору Иванову И. И. и подписать и исполнить договор займа от имени ООО) . Такого договора должно быть достаточно и для Банка, и для налоговой, да и для суда (если что-то вдруг) .
Удачи.

Тот, кто подписывает документы в соответствии с уставом или или иными документами. Может, даже и сам директор. Но если сделка крупная (см федеральный закон "Об обществах с ограниченной ответственностью"), то нужно согласие всех учредителей на сделку

это сделка с заинтресованностью, решение на собрании надо принимать. там же и решается вопрос - кто подпишет.
ВВЛ - не знает о чем говорит. крупность здесь не причем. поскольку: если сделка и крупная, и с заинтресованностью, то одобряется только как с заинтресованностью.