Вопрос по верстке (попытка 2 сделал более красиво). Скажите пожалуйста как правильней?

Красные блоки лучше поставить.
В некоторых браузерах может некорректно отобразиться макет т. к. логотип и баннер имеют свойство float - дающее обтекание, а меню под ними не должно обтекать. Поэтому лого и банер нужно спрятать в отдельный контейнер, либо после лого и банер перед меню нужно поставить разделяющий див со свойством clear:both

в шапке логотип - обязательно и со ссылкой на главную. - это просто уже общепринято.

баннер по вкусу. но согласен с DrEgor - это не всегда уместно.

красные блоки в сайдбаре - нормальный текстовый контент в две колонки там просто не поместится в большинстве случаев. если это рекламные блоки (для баннеров, например) , то им там самое место.
по поводу комментариев по верстке - то, что не относится к оформлению - это блоки. т. е. если логотип - это функциональный элемент со ссылкой, то это блок, а если это картинка - то это фон для блока header, например.
никакой "табличной" верстки не существует в принципе. есть семантически верное использование тегов и есть неверное. то, что называется "табличной" версткой - это семантически неправильное использование табличных тегов. только и всего.

и я бы не писал в макете "что-то". когда составляется макет структуры, то лучше быть конкретнее. тогда можно понять, где правильное место для этого "что-то" и сколько под "что-то" выделить этого места.

P.S. если вопрос об обертках - дополнительных элементах, то по возможности их лучше не делать. в верхнем блоке - он точно не нужен. в нижнем - в зависимости от того - что внутри.

Ув. Sanni, правильно и добавить блоки, показанные красным, правильно и не добавлять их. По большому счету, можно вообще обойтись одним блоком, поделив его фишкой (colspan, rowspan).
Вывод: делай, как тебе удобнее работать с кодом, чтобы самому не запутаться в нем.
А пользователю наплевать, он же не увидит твоих блоков. Он увидит конечный результат.
Удачи!

ты же не делаеш сайт о цирке? сайт должен быть примерно в одной цветовой группе, попробуйте использовать сервис http://www.colorhunter.com/

во втором случае красный оставить тока рядом с желтым, где зеленый - красный убрать.
будет интереснее

тулить рядом с логотипом баннер как-то не хорошо

вот прикидываю: если бы леонардо спрашивал - а не нарисовать ли джоконде водопад на заднем плане? или нарисовать...

а так ли уж нужна прогресствная сетка, может взять Мюллера Брокмана и не париться