подскажите дистрибутив linux, который можно адаптировать под военное применение: короткое время загрузки, надежность

Это что, оборонзаказ? Тогда попрошу предоплату.

Для военного применения есть военный дистрибутив МСВС. Читайте Википедию. Он адаптирован. Для планшетов есть адаптированный Андройд. Оба поддерживают ограниченное количество железа, только необходимое, и имеют ограниченное количество ПО. Министерство обороны свой выбор давно сделало и Ваше предложение вряд ли примет.

"Адаптировать" то можно многое, но сертифицировать получится не каждый :)
Мало того, что у нас в стране уже первое место среди военных дистрибутивов занял MCBC, так даже и второе место занято Astra Linux, сертифицированную под военное применение и предназначеную для защиты гостайны, включая "сов. секретно". ОС Астра Линукс — «Смоленск» прошла сертификацию по требованиям Приказа МО РФ №_58, в том числе на соответствие СВТ-3, НДВ-2, РДВ (ТУ) .
Кроме стандартных подсистем защиты, характерных для защищенных операционных систем (мандатное разграничение доступа, гарантированное уничтожение информации) , данная ОС включает механизмы защиты неизменности и подлинности загружаемых исполняемых файлов, поддержку технологии NX-бит, встроенные средства безопасной переписки по электронной почте. ОС поддерживает офисные продукты с системой маркировки документов при секретной печати, защищенную реляционную СУБД, средства контроля и управления доменами и др.

смешно.
у военных есть МСВС (читай: RedHat )

qnx берите.

тот который разрешит мин обороны, фсб, гру, ну и наконец наш новый министр генерал мчс

Насколько я понимаю, военное применение и обычное пользовательское применение это одно и то же. Потому что пользователь будь он даже с другой планеты будет использовать ПО. А военный Linux имеет сертификацию по стандартам военщины, сомневаюсь что перечисленное вами в том списке на 1 месте!

И чем программы сложнее тем они грузятся дольше. Выкиньте всё из автозагрузки.
Кроме того, операционная система вовсе не создана для быстрого старта. Там есть кэширование файлов, оно принудительно читает содержимое диска в оперативку. Убрав все ускорялки можно повысить скорость загрузки, но получить хреновый отклик OS.

OS быстро работает когда её не глушат, или восстанавливают из спящего режима. Считать с жёсткого диска оперативную память - самый быстрый способ старта. Ну или ждущий режим.

Используй SSD :) Любая операционка запускается секунды