Как добраться от Казанского Вокзала до Яузской аллеи д. 2 (ЦНИИ)? Говорят что электрички временно не ходят.

и действительно:
"Платформа № 1 о. п. Яуза закрывается на модернизацию с 14 апреля по 1 сентября 2016 года, поезда (как из Москвы, так на Москву) будут следовать без остановки. По рабочим дням планируется курсирование автобусов: с 6:30/6:00 до 14:00/14:30 - до/от Маленковской, с 14:30/15:00 до 23:00/22:30 - до/от Северянина. Проезд в автобусе осуществляется по билету на электричку. Расписание автобусов опубликовано на сайте." - http://www.tutu.ru/rasp_change.php?st1=20000&st2=46107

Через Маленковскую и Северянин с Москвы ехать автобусом как-то уж чересчур...
Обычно на Яузу, если не электричкой, то от метро ВДНХ едут: от "Космоса" (https://yandex.ru/maps/-/CVdUrG2D) или с конечной (https://yandex.ru/maps/-/CVdUrX3A) 56 автобус до конца и пройти мимо "Зонта" к лестнице, на мост и на другую сторону https://yandex.ru/maps/-/CVdUrNiS.
Или от м. "Ботанический сад", последний вагон из центра и через дорогу (https://yandex.ru/maps/-/CVdUrVpL) 603 автобус до туда же. Причем, по последним веяниям, на 603 будет удобнее и быстрее, т. к. 56 автобус сделали "синим" - ну и ездить он теперь будет минут через 20-25.

ЦНИИ находится на Садовом Кольце. При чем тут Яузская Аллея?

Да, пока платформа закрыта на реконструкцию поэтому лучшим вариантом будет такси вызвать, только смотрите чтобы цены были фиксированные, а не такими как водители придумывают сами, мне нравиться такси 1000 https://1000taxi.ru/moscow/rates и по деньгам и машины быстро подают, а если загрузить программку их на смартфон и бонус есть, удобно очень.

Такси. Чего ты там по ночам делаешь? Дома надо сидеть!) Надо же, а в интернет выход нашла. Это прям первостепенно, а то помрешь на месте без "ответов"?))