Какие органы чувств контролируют мысли?

мысли контролирует страж под названием бдительность... и если его нет в человеке то такой человек как сосуд наполненный и медом и дегтем одновременно...

Мысли относятся к нашей Истинной Сущности (первоисточник сознания), которая находится в ином измерении - в сущностном мире и связана с Нами через Сердце.
в Буддизме это называется "Сущность Будды", в Индуизме это называют Истинное Я (Атман, Брахман).
как пример: А́тман (санскр. आत्मन्, ātman IAST, «самость», «дух», «высшее Я») — одно из центральных понятий индийской философии и религии индуизма: вечная, неизменная духовная сущность, абсолют, осознающий своё собственное существование. Термин используется для описания высшего «Я» человека и всех живых существ. После «пробуждения» человек знает себя как «Атма» — «я не это, я ТО», «я есть абсолют, и я это знаю» — абсолют (человек) осознаёт своё существование. В качестве высшего субъективного начала, «абсолютного сознания», Атман соотносится с верховным объективным принципом, «абсолютным бытием» — Брахманом, в предельном случае отождествляясь с ним [1].

Мысли - штамп "к исполнению" на решениях хрен поймёшь чего. А органы чуств -- на другом "конце" от этих решений. Так что одно к другому отношения не имеет и никто в том бардаке ничего в психическом плане особо не контролирует. Дышать и такое прочее заставляют - это да, но это соматический уровень.

Если глаза видят приближающийся автомобиль, то возникает мысль, что дорогу переходить нельзя.
Если уши слышат удар грома, то возникает мысль, что надо перекреститься.
Если нос почувствовал запах вкусной еды, то возникает мысль, что её надо съесть.
И так далее...