Может ли различить фотограф с опытом 2 года где-то, что человек снимает на авто или с ручными настройками?

Светлана, если фотография качественная и грамотно снята, то вряд ли кто-то будет упрекать вас, что вы снимаете на авто. Это еще зависит от качества автоматики вашей техники, на которую вы снимаете. Единственное, как это можно узнать НА ГЛАЗ - это просто посмотреть штук 10 ваших фотографий. И если на них нет объема и все они однообразные, то можно сделать вывод, что человек не умеет пользоваться техникой и снимает именно в авто режиме. Да, среди фотографов это достаточно сильно порицается. Но если вы обладательница крутой гибридной фотокамеры с точной автоматикой замера экспозиции и баланса белого, то можете не переживать за это. Есть еще exif данные, которые сохраняются в момент съемки фотокамерой в самом файле с фотографией и там можно увидеть настройки и режим съемки данной фотографии. Далеко НЕ КАЖДЫЙ умеет их смотреть. При желании их можно удалить одной кнопкой в том же xnViever или посмотрите >ЭТО< видео

... только ручной режим позволяет заметно испоганить фотографию...

На глаз - сложно.
По EXIF`у - запросто.
.

Обычно не сможет.

1. Если "виден" EXIF, т. е. не удалён самим пользователем перед загрузкой или самим сервисом ("вконтакт" и "одноклассники", например, его удаляют, а вот *здесь* - он, по умолчанию, сохраняется, но доступ к нему есть на везде).

2. Если на фотографии очевидный промах (сильная недодержка или передержка), который автоматика в конкретном случае допустить не могла. Иными словами - если снимок экспонирован нормально, то понять кто или что выбрало параметры съёмки нельзя.

3. Ещё одно нечасто встречающееся исключение - "ручная" съёмка с очевидно длительными выдержками в условиях, когда это, чисто технически, не требовалось: ночная с "трассами" автомобильных фар, "туманная" вода, смазанные движением модели и т. п.; но здесь может быть использован и "приоритетный", полуавтоматический режим съёмки:
_

Все просто. Все зависит от сюжета. В случае с условно-типовым сюжетом ручные настройки не будут отличаться от автоматических. Но есть ситуации, где только ручные настройки позволят грамотно отстроить кадр. Например, в данном случае для реализации замысла фотографа используется дополнительное освещение и ручне настройки камеры.

Нет. Если ошибок нет.

легко можно понять, если снято со встроенной вспышкой

можно определить по ЭКЗИФ автоматический режим отмечается как Нормал

Фотограф снимает так, как ЕМУ удобно. Если снимок удачный, то какая разница на каком он там режиме сделан? Про постобработку уже сказали.

Сразу заявить об этом верно никто не в состоянии, только если человек не загрузил оригинал снимка и не посмотрел его свойства. Некоторые камеры записывают информацию о режимах съёмки в снимок.
p.s. Думаю без разницы как снимать и как обрабатывать снимки. Главное красивый и приятный результат.