Несколько раз заряжала Ni-Cd аккумулятор ЗУ, предназаначенным для Ni-MH. Могло ли это повлиять на качество их работы?

особо страшного ничего не должно произойти :)

Теоретически, могло. Если у Вас автоматическое зарядное устройство, расчитанное только на металл-гидридные аккумулыторы, то процесс заряда никель-кадмиевых аккумуляторов в нём будет остановлен ранее, чем аккумулятор будет реально полностью заряжен. С течением времени это приводит к снижению ёмкости аккумулятора.
В принципе, не криминал, конечно, учитывая невысокую стоимость аккумуляторов.
А вот попытка зарядить NiMH аккумуляторы в ЗУ для NiCd может привести к куда более серьезным последствиям.

З/У для обоих типов одинаковые.

Да, это повлияло на работу.
Есть 2 вещи, которыми отличаются устройства, предназначенные для зарядки только Ni-MH аккумуляторов от универсальных.

Во-первых, это предварительный разряд. Заряд без предварительного разряда Ni-Cd аккумуляторы переносят плохо, у них возникает то, что называют эффектом памяти. Чтобы не вдаваться в химические подробности, проявляется это как потеря ёмкости и увеличение внутреннего сопротивления, т. е. аккумулятор становится не способным отдать большой ток. Чтобы минимизировать нанесенный урон, нужно полностью разрядить аккумуляторы и полностью зарядить их, возможно, несколько раз. По поводу зарядного и разрядного токов существуют разные мнения. Если не учитывать разрядку обратным импульсным током, то, скорее всего, разницы особой нет, и вполне нормальным будет разрядка и зарядка равными токами 0.1С.

Во-вторых, Ni-MH аккумуляторы обычно заряжают бОльшим током, чем Ni-Cd. В результате часть воды в Ni-Cd аккумуляторе необратимо электролизуется и выходит в виде газов через клапаны. Это приводит к тем же последствиям, что и в предыдущем пункте.