Сколько служат аккумуляторы в фотоаппарате (зеркалке Canon) ?

1. Обычно у литиевых аккумуляторов ощутимое снижение ёмкости начинает наблюдаться через 2-3 года, но отпахать до непригодности к использованию они могут и 5-7 лет.
2. Хранить нужно заряженными, в идеале - заряженными на 60%. Ни в коем случае не хранить разряженными!
3. Лучше использовать равномерно. Беречь литиевый аккумулятор смысла нет - он стареет независимо о того, эксплуатируется он или просто хранится.

не хранить сухими. хватает на 1000 кадров. выкидывать можно через 5 лет

К сожалению, мне неизвестно никакое устройство для измерения ёмкости LiIon АКБ.
"Заметное снижение" ёмкости на глаз заметить сложно. Все литиевые аккумуляторы характеризуются достаточно хорошей сохранностью. Потеря емкости за счет саморазряда - 5-10 % в год. Обычно ресурс коммерческих Li-ion аккумуляторов до понижения разрядной емкости на 20 % составляет 500-1000 циклов.
Подзаряжать АКБ при "длительном перерыве в использовании", ИМХО, не стоит. Выходя на охоту, их нужно просто-напросто зарядить.

меня в сороковке уже 7-й год служат, пока что хватает

Не всегда равномерно служат. Иногда по 10-15 лет, иногда всего 5-7. Но чаще всего их хватает до смерти фотоаппарата по другим причинам.
При длительном перерыве заряжать их не надо. Достаточно один раз зарядить и оставить на полочке. Зеркалки не делают саморазряд, тушки с вставленными батарейками могут лежать месяцами не теряя емкости.
Хранить аккумы можно и в камере и отдельно. Главное не хранить подолгу (месяцы) разряженные.
Если есть два, то лично я бы купил батарейный блок, с ним удобнее. Но в целом беречь смысла нет, они выйдут из строя не раньше, чем 550д станет очень глубокой историей:) Даже намного более старые камеры 350д работают на своих родных батарейках по сей день без проблем.