Если на фотоаппарате в ручную выставить такие же настройки, которые показывает фотоаппарат в авто режиме

Нет

..фото будет отличаться exif -ом

Не будет, если речь идёт о съёмке одного и того же объекта в одних и тех же условиях.

Это интересное упражнение! Стоит поупражняться.
В принципе отличаться НЕ должно.

Если условия съёмки не изменятся, то не будет.

До того как фотоаппарат объединили с экспонометром и заставили мерять и использовать результаты замеров в автоматическом режиме, я пользовался отдельно экспонометром и отдельно фотоаппаратом.
В нынешней действительности Вы можете воспользоваться автоматикой аппарата для определения экспозиции и выставить все полученные данные в мануальном режиме съёмки.
Если это студия со стабильным светом, то результаты отличаться не будут.
Если это пленер, то результаты несколько отличаться будут из-за нестабильности условий освещения.

есть некоторые программные авторежимы, которые вручную нельзя повторить. в моём fujifilm XQ2 к примеру это:
1. PRO-фокус -фотоаппарат делает серию из 2-3 снимков и вычисляет размытие фона имитируя размытие фотоаппаратами с большой матрицей. (не всегда хорошо работает)
2. панорама - автоматически склеивает панораму из серии снимков
3. многократная экспозиция (совмещение нескольких снимков в один)
4. слабое освещение. фотоаппарат делает серию снимков и склеивает их в один тем самым компенсируя шумы матрицы

конечно, если идет съемка изменяющегося мира, ибо руками вы не успеете поставить все параметры какие выставит автомат подстраиваясь под освещение и тд и тп. а при статичном объекте съемки и освещении ничего не будет отличаться

С чего бы это?
Если абсолютно все настройки сделаете такие же, и будете снимать в тех же условиях, то отличий никаких не будет...

Фото отличаться не будет, вопрос в другом - устроит ли вас такой результат, который выдаст вам автоматический режим и который вы еще потом повторите? Смысл копировать настройки автомата в ручном режиме, если можно просто снимать в авто ?

А смысл??

Отличаются. CANON 1100D. Когда ещё не знал, где находится экспонометр, но хотелось попробовать ручной режим, повторил настройки с "авто" на "М". Получались пересвеченные фото. Естественно, не знаю, какой тогда стоял у меня режим экспозамера. Сын пробовал то же самое с каким-то Никоном. Результат был аналогичным.

Нет, разумеется.