Была ли православная инквизиция в России ?

она и сейчас есть

гонения на вероотступников на Руси -это не инквизиция

была и есть... огнём и мечом

Нет, но Церковь естественно боролась с ересями и расколами, в средние века естественно по средневековому, топором....

Лев Толстой в романе "Воскресение" приводит пример, что одного крестьянина, за то что он в селе собирал кружок по изучению Евангелия, без разрешения местного попа, сослали в Сибирь как государственного преступника.

Была, но Бог тут не причём - люди

да. ересь. хотя рпц отмалчивается по этому поводу

Инквизицией это назвать трудно, но во времена раскола старообрядцев отлавливали сажали в срубы и заставляли отрекаться. Самые упертые целыми семьями и деревнями уходили в сибирскую глушь, а то и за границу. Там и посейчас старообрядческие поселения есть. Хотя да, главарей жгли.

Случаи православной инквизиции: 
- 1071 г. — Убийство волхвов в Киеве ("и вринуша его беси в ровъ", Переяславский летописец). В том же году - в Ростово-Ярославской земле и в Новгороде восстания против произвола, творимого христианскими крестителями. В Ростове - Ян Вышатич пытал, а затем казнил волхвов. Лаврентьевская летопись: "Восстали два волхва близ Ярославля. И пришли на Белозеро, и было с ними людей 300. В то время случилось прийти от Святослава собирающему дань Яню, сыну Вышатину. Янь же повелел бить их и вырывать у них бороды. Когда их били и выдирали расщепом бороды, спросил их Янь: что же вам молвят Боги? Они же ответили: так нам Боги молвят: не быть нам живым от тебя. И сказал им Янь: то они вам правду поведали. И схватив их, убили и повесили на дубе". 
- 1069-76 г. — "Усмирение" славяно-финских язычников Белоозера Яном Вышатичем. "Повесть Временных Лет" и Летописец Переяславля-Залесского. В это же время князь Глеб Святославич и епископ Федор учиняют резню язычников в Новгороде. 
- 1091 гг. — Подавление волхвов в Ростове ("волхв погибе вскоре") - Переяславский Летописец. 
- XII век — Правила митрополита Иоанна: не давать причастия тому, кто ходит по волхвам. 
Это ныне кажется "несущественным", однако в те времена данная мера являлась вполне серьезным средством выключения гражданина из общественной жизни, наносила ущерб его чести и делала такового гражданина изгоем или "диссидентом". 
- XII век. — Изуверской жестокостью славился ростовский епископ Федор. Летописец говорит о нем, что он "немилостивый был мучитель, одним головы рубил, другим глаза выжигал и языки резал, иных распинал на стене и мучил немилостиво" (Полное собрание русских летописей). 
- 1227 г. — Новгород, четыре волхва были приведены на архиерейский двор и там сожжены: "изжьгоша волхвов четыре на Ярославлъ дворе" с разрешения архиепископа. Никоновская Летопись. 
- 1285 г. — Кормчая книга. "отлучать от церкви тех, кто ходят к волхвам и обавникам". 
- 1375 г. — Новгород. Казнь еретиков-стригольников. 
- 1411 г. — Псков. Сожжены 12 "вещих жонок" (колдуний, ведьм). 
- 1490 г. — Собор требовал смертной казни еретиков, Иван III воспрепятствовал. 
- Начало XVI века — Казнь Фомы, двоюродного брата Дмитрия Тверетинова (иконоборцы). 
- 1504 г. — собор постановил сжечь Ивана Волка-Курицина, Дмитрия Коноплева и Ивана Максимова в клетке, что и было осуществлено. 
- 1515 г. — Сожжено и уничтожено более 500 ведьм. (!) 
- 1505 г. — Поучения против язычества в "Грамоте митрополитов Фотия и Даниила", "Домострой" и "Стоглав" предписывают наказания волхвов и тех, кто знается с кудесниками. 
- XVI век — Новгородский епископ пишет митрополиту Зосиме: "Ано фрязове по своей вере како крепость держат! Сказывал ми посол цесарев про шпанского короля, как он свою землю очистил, и аз тех речей и список к тебе посылал - завидки берут и хочется перенимать опыт у инквизиции... " 
- 1682 г. (апрель) — сожжение Аввакуума, Лазаря, Федора, Епифания. 
- 1682 г. (5 июля) — сожжение священника Никиту Добрынина и других. 
- 1684 г. — Указ Иоакима: раскольников пытать, если не покорятся - казнить сожжением. Предусмотрена была и казнь за укрывательство. Стефан Яворский: "Еретиков достойно и праведно есть убивать, самем еретика полезно есть умерети, и благодеяние тем бывает, егда убивается". 
- 1716 г. — для старообрядцев введены двойные подати; с 1726 - четверные. 
Вот это как раз показывает нетерпимость христианской церкви к другим верованиям и попытка любыми средствами заставить их «прийти в лоно церкви». 
Ведь для людей, живущих своим трудом – четверные подати равносильны смерти.

сжигали деревнями

нет

Инквизиция - карательный орган КАТОЛИЧЕСКОЙ церкви. Домыслите сами.

Она и не заканчивалась.

Православной инквизиции не было.
А ваш Грекулов -предвзятый историк, писал свою книжку в советское время под давлением коммуняк - НЕ АВТОРИТЕТ.

Людей мочили, и тоже в большом количестве, (к счастью, поменьше чем в европе) но такой организации как инвизиция не было.

Была