Есть ли места Евангелии где Христос о том что христианство разделиться на несколько ветвей?

Нет такого места.
Но в Откровении есть "послание семи церквам", которое пророчествует историю церкви, и описывает разные ветви церкви.
Например про современную Католическую церковь написано "ты носишь имя будто жив, но ты мертв".

Есть места в Евангелии, где Христос о том, что в христианстве будет отступничество.
Например здесь, в Нагорной проповеди:
15 Берегитесь лжепророков, которые приходят к вам в овечьей одежде, а внутри суть волки хищные.
16 По плодам их узнаете их. Собирают ли с терновника виноград, или с репейника смоквы?
17 Так всякое дерево доброе приносит и плоды добрые, а худое дерево приносит и плоды худые.
18 Не может дерево доброе приносить плоды худые, ни дерево худое приносить плоды добрые.
19 Всякое дерево, не приносящее плода доброго, срубают и бросают в огонь.
20 Итак по плодам их узнаете их.
21 Не всякий, говорящий Мне: "Господи! Господи!", войдет в Царство Небесное, но исполняющий волю Отца Моего Небесного.
22 Многие скажут Мне в тот день: Господи! Господи! не от Твоего ли имени мы пророчествовали? и не Твоим ли именем бесов изгоняли? и не Твоим ли именем многие чудеса творили?
23 И тогда объявлю им: Я никогда не знал вас; отойдите от Меня, делающие беззаконие.
(От Матфея 7:15-23)

Все религии, а также их ветви не могут быть правильными. Правильной религией может быть только одна, которую одобряет Бог и которая соответствует библейскому образцу.

в апокрифах есть строки где он говорит что его слова извратят и создадут на их основе ложную религию и именем его будут творить зло.

Нет. Все люди делятся на верующих, либо на неверующих. Но верующие должны приносить плод - делами являть свою веру