Почему в советские времена атеисты при всякой трудности говорили "с Богом",а сегодняшние даже и просто так не упоминают?

Да, раньше говорили "О господи, какая же ты дура", или "Боже, какая уродина!" или "Ну, поезжай с богом", или "Ну ладно, я тебя прощаю, бог с тобой" или "чёрт с тобой".- это всё просто старые обороты речи, которые произносились чисто механически. Никто не вкладывал в это какой-то религиозный смысл.

В советские времена говорили не только "с Богом!", но и "кто не работает, тот не ест" и, даже, "не хлебом единым". Хотя не понимали откуда это.
А Хрущёв выдвинул лозунг, широко рекламируемый: "Перекуём мечи на орала!". Речь шла о разоружении. И тоже, мало кто знал откуда это и что за "орал".
Перестают употреблять боговдохновенные фразы лишь в одном случае - когда религия стала штампом и люди от них устают. Это, когда-то, привело к революции.

Слово человеческое уже давно потеряло вес и значение. И даже слыша "Клянусь матерью", в 98% можно нарваться на ложь и обман.)

Как в библии пишется - нельзя упоминать имя господа по напрасну. Т. е говорить "господи!, боже, с богом".

"темные" были атеисты, подстраховывались, а вдруг верунисты не врут и Бог их отшлепает.))

в советские времена говорили за родину за сталина.

Хороший вопрос . Хорошо подметили.
Многие задумываются, почему верующих стало больше а честных меньше?

В Вашем вопросе немного софистики, подмена понятий. Где гарантия, что именно атеисты говорили в советское время так? Были ли они атеистами? Или скажу по другому, если человек так говорил, он - не атеист. Ибо это противоречит самому определению атеизма. Те же люди говорили "Ни пуха, ни пера! - К черту!" И они - не атеисты! Глубокого смысла для сказавших эти фразы людей нету.