Почему в прошлом Бог позволял вступать в брак братьям и сестрам

На заре человеческой истории браки между близкими родственниками были неизбежны. Даже после того как стали проявляться последствия греха Адама и Евы, риск рождения детей с явными пороками развития был сравнительно невелик, поскольку тогда люди были гораздо ближе к совершенству. Это подтверждается продолжительностью жизни людей в то время. (См. Бытие 5:3—8; 25:7.) Однако спустя примерно 2 500 лет после согрешения Адама Бог запретил кровосмесительные браки. Этот запрет защищал потомство и ставил половую мораль служителей Бога выше половой морали соседних народов, которые участвовали во всевозможных непристойных делах. (См. Левит 18:2—18.)

Первые люди имели хорошее здоровье и браки братьев с сестрами давали здоровое потомство. Позже здоровье людей ухудшилось и по законам генетики такие браки уже стали давать больное потомство.

Чтобы с иноплеменниками не спаривались.

на самом деле наши предки тоже избегали инцеста еще сотни тысяч лет назад.

Он никогда не позволял . Просто раньше было мало людей осподь Бог образовал из земли всех животных полевых и всех птиц небесных, и привел к человеку, чтобы видеть, как он назовет их, и чтобы, как наречет человек всякую душу живую, так и было имя ей.
И нарек человек имена всем скотам и птицам небесным и всем зверям полевым; но для человека не нашлось помощника, подобного ему.
И навел Господь Бог на человека крепкий сон; и, когда он уснул, взял одно из ребра его, и закрыл то место плотию.
И создал Господь Бог из ребра, взятого у человека, жену, и привел ее к человеку.
И сказал человек: вот, это кость от костей моих и плоть от плоти моей; она будет называться женою, ибо взята от мужа.
Потому оставит человек отца своего и мать свою и прилепится к жене своей; и будут одна плоть. одна плоть, а не многоплотный человек .

Возможно некоторые последствия от таких семей и сам Бог не мог предположить? )))

Почему интересуешься?

Для размножения, чтобы заселить землю-Бытие 1:28

Потому что они недалеко ушли от Совершенства, и к тому же людей, тогда в древности, было не так много..

Потому что людей было мало.
А когда стало достаточно, тогда было наложено ограничение.

Бог делал что-то потому что он Бог. Он вне времени, вне причин и не требует оправдания и защиты. Другое дело - вопрос о том, как верующему в Бога уместить это в своей голове.