Как это правильно понимать? "А в городах сих народов, которых Господь, Бог твой,

Никакого тайного подтекста нет, заклятье означает уничтожение. Синодальный перевод очень старый и использует слова которые мы сейчас не употребляем или которые имеют другой смысл, нежели мы сейчас в них вкладываем. Читайте Библию в современных переводах..

Вот как в других переводах написано.

Полностью уничтожь их — хеттов, аморреев, хананеев, ферезеев, хиввеев и иевусеев, как повелел тебе Господь, твой Бог.

истреби полностью хеттеев, аморреев, хананеев, ферезеев, еввеев и иевусеев, потому что Господь, Бог твой, повелел тебе сделать это.

Полностью уничтожьте хе́ттов, аморе́ев, ханане́ев, ферезе́ев, хиве́ев и иевусе́ев⁠, как велел ваш Бог.

Заклятие
Заклятие [евр. херем]. Предавать З. означает отлучать к.-л. лицо, животное или предмет от мира человеч. существования и отдавать его в распоряжение Бога. Как правило, существо или предмет, предаваемые З., уничтожались. Именно поэтому они считались священными. харамЕвр означает «предавать уничтожению, уничтожать», эфиоп. харама – «отлучать от мирского общества» (ср. также араб. харем).
Здесь это понятие употребляется применит. к войнам и обозначает полное уничтожение городов, людей, животных и вещей

Отправить на тот свет , потому что язычники за (вне ) клятвы с Богом

А в городах сих народов, которых Господь Бог твой дает тебе во владение, не оставляй в живых ни одной души, но предай их заклятию: Хеттеев и Аморреев, и Хананеев, и Ферезеев, и Евеев, и Иевусеев, как повелел тебе Господь Бог твой, дабы они не научили вас делать такие же мерзости, какие они делали для богов своих, и дабы вы не грешили пред Господом Богом вашим

«Не оставляй в живых ни одной души», — во избежание соблазна идолопоклонством (18 ст.). Ср. Исх XXIII:32−33; Втор VII:2; IX:3; XII:2, 3.

закланию может. ясно же написано - всех уничтожить.

Это у кабаллистов надо спрашивать.