Как искреннему человеку исполнить это повеление, если он считает, что.. церковь это от Бога,но считает +

Не соучаствовать с беззаконниками в их беззакониях.
Даже если они называют себя верующими или одеты в красивую одежду.
Соучаствовать в делах правды с праведниками.

9 Я писал вам в послании — не сообщаться с блудниками;
10 впрочем не вообще с блудниками мира сего, или лихоимцами, или хищниками, или идолослужителями, ибо иначе надлежало бы вам выйти из мира сего,
11 но я писал вам не сообщаться с тем, кто, называясь братом, остается блудником, или лихоимцем, или идолослужителем, или злоречивым, или пьяницею, или хищником; с таким даже и не есть вместе.
(Первое послание к Коринфянам, глава 5)

Искреннему человеку Бог даёт разумение того , что лицемерие одного священника не нужно переносить на всех священников

Надо их вразумить.

верующие и неверующие противоположны, так же, как противоположны свет и тьма. Они просто не имеют ничего общего, как и Христос не имеет ничего общего с Велиаром, что на еврейском языке означает

никчемный ..

для христианина вступить в партнерство с неверующим
означает навлечь на себя беду. Они имеют противоположные взгляды
на мир и мораль, и бизнес-решения, принимаемые ежедневно,
будут отражать позицию одного или второго.
Чтоб отношения работали, одному или другому придется отказаться от своего морального центра и двигаться в сторону другого.
Чаще всего верующий оставляет свои христианские принципы
ради прибыли и роста бизнеса.

"но считает +
лицемерными священников?"
на основании чего?

Перестать общаться с неверующими.

Мф. 23:3
Толкование
https://bible.optina.ru/new:mf:23:03

Не стоит верить во всякую муйню...

Ну, если этот замечательный искренний человек считает всех без исключения священников лицемерными, то может ему стоит почитать про такое понятие - Гордыня?