Вопрос к тем, кто учил русский язык в школе.

Итак, название статьи.
Оно может быть и с вопросительным знаком, и без него. С вопросительным знаком было бы в том случае, если автор статьи, сам не зная ответа, пытался бы разобраться в окружающих страну "супостатах". Т. е. выдвигать мнения, комментиировать их и прочее. Но у Вас, судя по данному контексту, вопроса нет. Это уже утвержддение. Журналист уже знает об истинных врагах и прелагает читателю "познакомиться" с ними. Думаю, сочетание "на самом деле" вводным не является, т. к. не выражает ни одно из значений вводных конструкций. Поэтому обособлять его на письме запятыми не стоит. Более подробно почитайте о вводных словах и конструкциях.

Что касается подзаголовка к статье, то тут совсем легко.
"В статье рассказывается, (о чем? - сложноподчиненное предложение) кто является историческим врагом Украины и кого государству (стране, ей) не стоит опасаться? В предикативной части лучше убрать повторяющееся слово "Украине", чтобы избежать тавтологии. Запятая перед союзом "кого" не ставится, т. к однородные придаточные.

Кто враг Украины? Просто и лаконично.
В статье рассказывается, кто является историческим врагом Украины и кого ей следует опасаться.
На мой взгляд, так лучше.

кто, на самом деле, является врагом Украины? ставится т. к вводное слово... Кто враг Украины? В статье рассказывается, кто является историческим врагом Украины и кого ей следует опасаться... ставиться перед кто запятая т. к в статье рассказывается что? связь дополнение между частями

Кто, на самом деле, является врагом Украины?