А почему в народе обычно считают, что метис - это хорошо в биологическом плане, а вот ученые думают наоборот?

Если так думает - значит не учёный, а дурак и/или расист.
Потомство от смешанных браков более устойчиво - это же, матушка, азы генетики!
А Вы мне говорите...

Учёные? Посмотри на дворняг. Намного выносливее любого чистопородного пса.

Потому что в народе очень многие понятия и причинно-следственные связи путают.
Во-первых, многие судят по принципу "а у нас в деревне". Вспоминают Бобика, которому прививок не делали, к ветеринару не водили, костями кормили, а он 10 лет прожил. Только упускают тот факт, что Бобик при нормальном уходе мог бы прожить 15 лет. А до Бобика от болезней и отсутствия лечения умер Шарик, Барбос, Рекс и Мухтар. В итоге появляется мифический образ беспородного и стойкого ко всем болезням Бобика.
Во-вторых, многие думают, что если дворняжка или метис, то обязательно с умением выживать. Вот тут не надо путать просто смешение кровей разных собак и естественный отбор. Сильнейший выживает на улице: собака родила где-то в подвале, съела слабых щенков, ещё парочка щенков умерла от инфекции, ещё один попал под машину - выжил сильнейший. Если же собака родила беспородных щенков где-то дома у более-менее приличного хозяина, то щенки уже вряд ли умрут от холода, голода и невнимательного водителя.
В-третьих, при смешении кровей не всегда щенок унаследует лучшие качества. Как говорили в фильме: "Я уж не говорю о его родословной: наполовину пудель, наполовину эрдель! Причём обе половины худшие". Щенки могут вместо сильных генов родителей унаследовать от обоих наследственные заболевания и не самые сопоставимые пропорции тела (допустим, высокие лапы от левретки и длинное туловище от таксы - у собаки будут проблемы с позвоночником) .
В-четвёртых, при слове "дворняжка" или "метис" большинство представляет собаку средних размеров, со средней длиной шерсти, с волчьей (длинной) мордой. Про то, что маленькие и брехливые собачки и огромные сторожевые псы тоже бывают беспородными, народ забывает.
В-пятых, универсальных собак нет. И если порода выводится с какой-то целью: охота, пастушья работа, работа в упряжке, охрана и защита, - то у беспородной собаки цели выведения нет. И тут уже как гены лягут. Мало того, что нельзя взять беспородную собаку и быть уверенным в том, что на пойдёт с вами на охоту или начнёт вас защищать (может у неё в предках пудель и болонка - какая тут защита?) , так гены могут ещё и гремучую смесь учудить: желание охотиться от фокстерьера и размеры от среднеазиатской овчарки. Вот и удержи такое чудо, которое во всём подчинено инстинкту охотника, но при этом весит как телёнок.

Так что, хорошее и плохое тут исключительно в конкретных особях. Это просто игра на удачу: даже зная, кем были предки щенка, вы вряд ли угадаете, как параметры этих двух разных пород или беспородных собак соединятся. И если уж заводить собаку без породы, то не с конкретной целью, т. к. можно сильно разочароваться. И быть готовым к тому, чтобы управляться с любыми наклонностями собаки. которые у неё появятся: брали милую собачку для игр с детьми, а вырос серьёзный сторож - вот и работайте со сторожем.
Поэтому, это весьма рисковое мероприятие.

Метис у любого народа считается низшей кастой. И не важно то то вы там себе нафантазировали.

Никто в народе так не считает