Хочу организовать файлы, заметки, записки.

Пиши в тетрадку ручкой)))

Папки - есть такая штука в Винде. Специально для каталогизации файлов созданы.

для тебя лучше всего OneNote
всё в облаке.
структуру сам делаешь
регистрация дармовая
работа в браузере.
Успехов!

cherrytree
— это небольшое десктопное приложение, написанное на Python и предоставляющее вам широкие возможности для хранения и упорядочивания текстовой и графической информации. Данные в программе представляются в виде дерева — классического способа упорядочивания информации. Дерево состоит из т. н. нод (node), в которых и хранятся данные. Каждая нода может содержать любое количество дочерних нод, которые, в свою очередь, своих дочерних нод и так далее. Вот и весь принцип.
http://ashep.org/2012/cherrytree-strukturiruem-zametki/#.XjoZSo7VJhE

1. Многоуровневая структура. Можно создавать разветвленные иерархические системы, с подчинением одних заметок другим. Можно простым перетаскиванием изменять расположение заметок.
2. Полная поддержка ссылок. Причем не только ссылок на объекты в сети, но и на другие заметки в рамках программы, на файлы и каталоги.
3. Поддержка тегов.
4. Возможность создавать независимые друг от друга базы данных заметок.
5. Возможность экспорта данных (свой формат + PDF + простой текст + HTML). Импорт данных (из альтернативны программ для заметок — Basket, Tomboy, KeepNote и многие другие).
6. Удобная вставка вспомогательных элементов — изображений, таблиц, а также блоков программного кода.
7. Немного замороченный, но все же вполне сносный поиск (замороченность в том, что поиск ведется отдельно по веткам и отдельно по содержимому заметок).
8. Редактирование текста заметок (размер, цвет, тип шрифтов, цвет фона). Особенно стоит отметить продуманные списки (автоматическое проставление номеров списка, список дел To-Do, где можно отмечать выполненные задачи).
9. Кроме Linux поддерживается версия под Windows. Полезно будет не только для дезертиров, но и для людей, вынужденных в дополнение к нашей любимой ОС пользоваться Windows.
10. Закладки.
11. Сочетания горячих клавиш для многих операций.
https://pingvinus.ru/program/cherrytree

Evernote