1с на sql, почему тормозит?

Чтобы не гадать, а ответить что-то внятное, необходимо знать параметры сервера и сетевого оборудования, релиз платформы, наименования и релизы конфигураций, конфигурации типовые или дорабатывались, используется ли РИБ. размеры баз, битность сервера 1с, режимы запуска, есть ли удаленное подключение через интернет, настройки MS SQL...

Из причин: не оптимальный код (если дорабатывались) или где-то есть "узкое место", которое необходимо найти.

А так у нас например есть клиенты, у которых 300+ юзеров в УПП и УТ на MS SQL - полет нормальный.

Группа компаний "Онлайн".
Официальный партнер фирмы 1С с 1995 г.
online-ufa.ru

Первое что я посоветую, - проверить релиз! Есть глючные релизы, есть более стабильные рекомендую 8.3.8.2167
Второе, нужно отключить журнал регистрации в базах где это не требуется (обычно в копиях баз это сделать забывают)
Третье, заблокировать фоновые задания в копиях баз, а в основной базе настроить их на более "плавный режим"
Четвертое, проверить включен ли технологический журнал, и отключить его (если не пользуетесь)
А ну и пятое, в свойствах SQL-базы из (МенеджментСтудии) установить Модель восстановления - Простая

Судя по всему у вас там проблема с блокировкой таблиц базы данных, переходите на PostgreSQL, там блокируются только строки а не вся таблица, можно хоть миллион пользователей подцепить - скорость работы с базой данных не особо страдает.