Почему? Почему при патронах одинакового калибра, стреляя с разных винтовок, пистолетов, пробивная мощь разная?

Потому, что начальная скорость пули везде разная. На практике имеет значение длина ствола, т. е. чем он дольше - тем больше времени пороховые газы создают давление на пулю и следовательно - тем больше начальная скорость и пробивная мощь.

Мож из первого стреляют по шарикам воздушным, а из другого в бетонную тумбу. Уточнения по этому пункту я не увидел.

Вопрос из серии - Бензин одинаковый, а разные машины - по-разному ездят!
Сам-же ответил - РАЗНОЕ оружие, (длина ствола, нарезка, конструкция газоотведения и т. д.)

Потому что заряд пороха всегда хоть на капельку, но отличается, а во вторых внешние условия всегда тоже немного различаются (плотность воздуха, скорость ветра, температура, все это влияет по чуть чуть).

И кроме начальной скорости влияет еще и сама пуля, которые бывают разные при одном калибре.
А еще влияет плотность воздуха по траектории полета, влажность (дождь) , угол вхождения, скорость вращения, разные материалы реагируют по-разному на тип пули и многое другое.

калибр ето ещё не всё. есть много отличий, длиноствольное или короткоствольное, гладкоствольное или нарезное, размер гильзы и другое. если не верите, почитайте про оружие.

длина ствола имеет значение

Длина ствола зависит и бывает калибр одинаковый а по длине патроны разные получается пороху больше.

Потому что пробивная способность винтовки зависит от её тактико-технических характеристик. На начальную скорость пули могут влиять множество факторов: способ отвода пороховых газов длина ствола, качество его изготовления, износ, чистка и пр. А вобще я не спец. По гуглите на досуге… Найдете то что нужно.