Можно ли заменить питающие элементы Д-0,125Д (3шт) на один аккумулятор Li-ion 3.6V в дозиметре BGRAI-01?

Нет. Напряжение в 3 раза отличается. Если только не три последовательно Д-шки стоят.

Можно, напряжение как раз совпадает (3х1,2=3,6).
Но заряжать литиевый аккумулятор зарядником для никель-кадмиевых нельзя!

Нужно !

Время непрерывной работы прибора дозиметр BGRAI-01 в условиях нормального радиационного фона 15мкР/ч - не менее 100 часов;
Технические характеристики элемента Д-0,125:
Номинальная емкость: 125 мА/ч,..
считай сам

Можно, там и там 3,6 вольта....

Надо, что бы напряжение питания дозиметра не отличалось от того, что было. Иначе вы получите совсем другой эффект. Как я понимаю, блокинг там не стабилизирован и вместо 400 вольт, вы получите бОльшее напряжение, что не есть хорошо.
У старого - напряжение 1,25 вольта, у нового 3,7 вольта. Разницу увидели?
Ответ: если один на один - нельзя.

Поскольку вопрос изменен - ответ будет такой: суммарное напряжение на контактах прибора должно быть одно и то же при питании от других источников.

Меняй, если по напряжению подходят

Мозг включи и подумай. Один 1,2 вольта, второй 3,6.

Почему нет. 1,25*3 = 3,75 В. Один литий 3,7 В.

Можно, почему нет. Напряжение от старых элементов, соединенных последовательно, где то 3,6 Вольта и есть. Только по емкости - Д-0,125 никогда не отдаст 125 мА/ч, там все намного печальнее, даже если они свежие и полностью заряженные. Современный литий-ионный аккумулятор на 3,6 Вольта можно подобрать с гораздо более лучшей емкостью.